父子一户两宅的合法性取决于具体情况，以下是对此问题的详细分析：

1. 合法情形：

   • 通过合法继承取得：根据我国法律规定，继承人可以继承被继承人的房屋并获得相应宅基地使用权，即使已拥有一处宅基地。这种情况下，父子一户两宅是合法的。例如，父亲去世后，儿子继承了父亲的房屋和宅基地使用权，同时儿子自己也有一处宅基地，这就形成了一户两宅，但属于合法继承。
   • 宅基地总面积符合标准：如果两处宅基地的总面积未超过当地规定的宅基地面积标准，这种一户两宅通常也是合法的。比如，当地规定一户宅基地面积标准是200平方米，而父子两处宅基地总面积未超过这个标准，那么就是合法的。
   • 因管理部门衔接问题造成：在过去农村宅基地管理不规范时，可能因管理部门衔接不畅导致一户两宅。只要能证明是管理部门的问题且村民无过错，这种情况也可认定为合法。
   • 符合分户条件但未分户：如果父子实际上已经符合分户条件，但由于户籍管理制度等原因尚未分户，他们拥有两处宅基地，在后续完成分户手续后，可合法化。例如，儿子已经成年并结婚，但户籍仍与父亲在一起，此时他们拥有两处宅基地，待分户后即可合法。
   • 历史遗留问题：由于历史原因或政策调整导致的一户多宅情况，需结合具体历史背景和当时政策环境判断其合法性。如果符合相关规定，也可能被视为合法。
   • 实际使用情况合规：两处宅基地的使用均符合相关规定，没有违反其他法律条款。例如，一处用于居住，另一处用于农业生产或其他合法用途，且均符合当地宅基地使用规定。

2. 不合法情形：

   • 未经批准私自建造：父子未经任何合法审批程序擅自在集体土地上建造第二处住宅，违反了《土地管理法》等相关法律法规，属于违法占地建房。这种情况下，一户两宅是不合法的。
   • 通过非法手段获取：采用欺骗、贿赂等不正当手段取得第二处宅基地的审批手续，严重违反了法律规定，所取得的宅基地权益不受法律保护。这种情况下，一户两宅同样是不合法的。

综合考量因素与建议：

• 在判断父子一户两宅是否合法时，需要综合考虑宅基地的取得方式、面积标准、历史遗留问题以及是否符合分户条件等因素。
• 如果对宅基地的合法性存在疑问，建议咨询当地土地管理部门或相关机构，了解具体的宅基地管理政策和规定。
• 如果确实存在一户两宅的情况，且希望使其合法化，可以考虑通过分户、继承、转让等方式进行合规处理。但具体操作需根据当地政策和规定进行，并确保符合相关法律法规的要求。

法律后果提示：

• 如果一户两宅被认定为非法，可能会面临被责令退还非法占用的土地、限期拆除在非法占用的土地上新建的房屋等法律后果。
• 因此，在处理宅基地问题时，务必确保合法合规，避免不必要的法律风险。

如有任何关于宅基地或其他法律问题的疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。