关于您父亲拥有两处宅基地是否合法的问题，这主要取决于具体的法律规定和实际情况，以下分情况讨论：
符合“一户一宅”原则的情况：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。这是“一户一宅”的基本原则。
- 如果您的家庭实际上只被视为一户，但拥有两处宅基地，且这两处宅基地的总面积并未超过当地规定的标准，或者其中一处宅基地是通过继承、赠与等合法方式取得，且符合当地政策规定，那么这种情况可能是合法的。不过，具体是否合法还需根据当地的具体政策和规定来判断，因为不同地区对于宅基地的管理和分配可能存在差异。
不符合“一户一宅”原则的情况：
- 如果您的家庭被明确视为两户或更多户，但其中一户或几户拥有超过一处宅基地，或者虽然只被视为一户，但拥有的两处宅基地总面积超过了当地规定的标准，那么这种情况通常是不合法的。
- 在这种情况下，超出的宅基地部分可能会面临被收回、罚款或其他法律后果。具体处理方式还需根据当地的相关法律法规和政策规定来确定。
法律建议：
- 了解当地政策：首先，建议您详细了解当地关于宅基地管理的具体政策和规定，包括“一户一宅”的具体解释、宅基地面积的标准、继承和赠与宅基地的规定等。
- 咨询相关部门：如果您对当地政策有疑问或不确定，可以咨询当地的土地管理部门或农业部门，他们可以提供更具体和权威的解答。
- 合法合规处理：如果发现您的家庭拥有的宅基地存在不符合规定的情况，建议及时与相关部门沟通，了解如何合法合规地处理这些问题，以避免可能的法律后果。
可能面临的法律后果：
- 如果宅基地的使用不符合规定，可能会面临被收回、罚款等行政处罚。
- 在极端情况下，如果涉及非法转让、出租宅基地等违法行为，还可能面临刑事责任。
总结：您父亲拥有两处宅基地是否合法，取决于具体的法律规定和实际情况。建议您详细了解当地政策，咨询相关部门，并合法合规地处理宅基地问题。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。