员工旷工一天罚款三天工资的做法，在大多数情况下是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：

法律法规层面

1. 《劳动法》与《劳动合同法》的规定

   • 我国《劳动法》和《劳动合同法》明确规定，用人单位应按时足额支付劳动者劳动报酬，并未赋予用人单位对员工进行罚款的权利。这意味着，用人单位不能随意对员工进行罚款，包括以旷工为由进行罚款。
   • 《劳动合同法》第三十条也强调，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这进一步保护了劳动者的工资权益，防止用人单位无故克扣工资。

2. 《工资支付暂行规定》的解读

   • 《工资支付暂行规定》第十六条指出，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，且扣除部分不得超过月工资的20%，并需保障剩余工资不低于当地最低工资标准。
   • 旷工一天并不直接等同于给用人单位造成经济损失，因此直接扣三天工资缺乏法律依据。即使劳动者旷工给用人单位造成了经济损失，用人单位也只能按照上述规定进行赔偿扣除，而不能随意扩大扣除范围。

法理角度考量

• 从公平合理原则出发，旷工一天仅代表劳动者当天未提供劳动，用人单位有权不支付当天的工资作为对缺勤行为的回应。但额外扣除两天工资则构成了超出合理范围的惩罚，损害了劳动者的合法权益，破坏了劳动关系的和谐稳定。
• 劳动法的立法目的之一是保护劳动者的合法权益，促进劳动关系的和谐稳定。用人单位对员工进行过度惩罚，不仅违反了劳动法的原则和精神，也可能引发劳动争议和纠纷，不利于劳动关系的长期稳定发展。

规章制度的有效性

• 尽管某些用人单位的规章制度中可能规定了“旷工一天扣三天工资”的条款，但这并不意味着该条款必然合法有效。规章制度的制定需通过民主程序，内容不得违反法律法规，且必须向劳动者公示或告知。
• 即使规章制度经过了合法的程序制定和公示，如果其内容违反了法律法规的强制性规定或公平合理原则，也可能在司法实践中被视为无效。因此，用人单位不能仅凭规章制度中的条款就对员工进行过度惩罚。

劳动者的应对措施

• 面对不合理的克扣工资行为，劳动者首先应与用人单位协商解决，要求用人单位返还多扣的工资。
• 如果协商不成，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。劳动监察部门或劳动仲裁机构将依法对用人单位的违法行为进行查处，并责令用人单位限期支付克扣的工资。

综合建议

• 用人单位：在制定规章制度时，应确保其内容符合法律法规的要求，避免过度惩罚员工。可以制定合理的旷工处理办法，如扣除旷工当天的工资或给予一定的警告、记过等处分，以维护劳动关系的和谐稳定。
• 劳动者：在遇到类似纠纷时，应了解自己的权益并采取适当的法律措施来维权。可以向用人单位提出异议，要求其返还多扣的工资；如果用人单位不予理会，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

总之，员工旷工一天罚款三天工资的做法在大多数情况下是不合法的。用人单位应遵守相关法律法规，制定合理的规章制度；劳动者也应了解自己的权益，并在遇到纠纷时及时采取法律措施来维权。如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，可以直接向我咨询。