结论前置：

1. 一般情况下，旷工罚三天工资是不合法的，因为这通常构成了对劳动者劳动报酬的变相克扣，违反了《中华人民共和国劳动法》中关于工资支付的规定。
2. 但在特定情况下，如果公司规章制度明确、合法且经过公示或员工同意，并且扣除的工资符合法律规定的限额，那么可能被视为合法。不过，这种合法性也是有限度的，不能随意扩大。

详细分析：

法律规定角度

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，且不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，劳动者提供了正常劳动后，有权获得相应的劳动报酬，用人单位无权随意克扣。旷工罚三天工资的做法，即除了旷工当天不支付工资外，还额外扣除两天工资，实际上构成了变相克扣工资，因此通常是不合法的。

旷工当天工资的扣除

如果劳动者旷工，用人单位有权利不支付旷工当天的工资。例如，某劳动者月工资为3000元，按照月计薪天数21.75天计算，日工资约为137.93元（\(3000{\\div}21.75\)）。若该劳动者旷工一天，用人单位可以合法地不支付这137.93元。但额外扣除其他天数的工资则缺乏法律依据。

企业规章制度的合法性

虽然企业有权根据自身情况制定管理制度或劳动合同来约定旷工的处理办法，但这些规定必须合法、合理，且不违反劳动法的原则和精神。如果企业的规章制度或劳动合同中明确规定了旷工一天将扣3天工资，并且这一规定经过了合法的程序制定和公示，从形式上看似乎具有合法性。然而，这并不意味着所有类似的扣罚方式都是合理的。企业在制定规章制度时，应确保规定的合理性、公平性，并充分考虑到员工的权益和感受。扣罚方式不应过分严厉，以至于构成对劳动者劳动报酬权利的侵犯。

经济损失的赔偿

如果劳动者旷工给用人单位造成了经济损失，用人单位可以按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但赔偿的扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。这意味着，即使劳动者旷工给用人单位造成了损失，用人单位也不能随意扣除大量工资作为赔偿。

综合考量与建议

1. 对于用人单位：在制定和执行旷工扣罚制度时，应确保规定的合法性和合理性。避免直接扣除多天工资作为惩罚，而是应依据旷工天数合理扣除相应工资，并确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准。同时，应加强与员工的沟通，确保员工了解并同意公司的规章制度。
2. 对于劳动者：应了解自己的权益和义务，遵守公司的规章制度和劳动合同的约定。如果认为公司的扣罚制度不合理或违法，可以通过与用人单位协商、向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁等方式来维护自己的合法权益。

举例说明：

假设某公司规定旷工一天扣三天工资，某员工月工资为5000元，月计薪天数为21.75天，日工资约为229.89元（\(5000{\\div}21.75\)）。若该员工旷工一天，按照公司规定应扣除689.67元（\(229.89元\\times3\)）。但根据法律规定，公司只能合法地不支付旷工当天的工资229.89元。如果公司额外扣除459.78元作为惩罚，则构成了变相克扣工资，是违法的。

法律后果：

如果用人单位存在克扣工资的情况，劳动者可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。劳动监察部门或劳动仲裁机构将依法对用人单位进行处罚，并要求用人单位支付被克扣的工资及可能的赔偿金。

综上所述，旷工罚三天工资的做法在法律上通常是不合法的。用人单位在制定和执行相关规章制度时，应谨慎考虑各方面因素，确保规定的公平、公正和合理；劳动者也应了解相关法律法规，以便在权益受到侵害时及时维权。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。