结论：工资被扣一千多是否违法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 合法扣减工资的情形：

   • 法定扣减：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。举例：若你当月工资为5000元，因工作失误给公司造成损失，公司最多只能扣减你1000元（即5000元的20%），且扣除后你的工资不得低于当地最低工资标准。
   • 约定扣减：如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了某些情况下可以扣减工资，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照约定扣减工资可能是合法的。举例：劳动合同中约定，员工迟到一次扣减工资50元，若你当月迟到多次，公司按照约定扣减工资是合法的。

2. 非法扣减工资的情形：

   • 无合法依据扣减：如果公司没有法定或约定的理由，擅自扣减你的工资，那么这种行为是违法的。举例：公司以“业绩不达标”为由扣减你工资，但劳动合同或公司规章制度中并未规定业绩不达标可以扣减工资，且公司无法提供其他合法依据，那么这种扣减就是违法的。
   • 扣减比例超过法定限制：即使公司有合法依据扣减工资，但如果扣减的比例超过了法定限制（即每月扣减的部分不得超过劳动者当月工资的20%），那么超出部分也是违法的。举例：你当月工资为3000元，公司因你违反规章制度扣减你1000元，但按照法律规定，公司最多只能扣减你600元（即3000元的20%），超出部分400元就是违法的。

3. 法律建议：

   • 核实扣减依据：首先，你需要核实公司扣减工资的依据是否合法，包括是否符合法律法规的规定、是否在劳动合同或公司规章制度中有明确约定等。
   • 与公司沟通：如果公司扣减工资的依据不合法或存在争议，你可以与公司进行沟通，要求公司说明扣减的具体原因和依据，并尝试协商解决。
   • 寻求法律援助：如果沟通无果，你可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

可能法律后果：如果公司非法扣减工资，除了需要补发被扣减的工资外，还可能面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。同时，你也有权要求公司支付因非法扣减工资而产生的经济补偿或赔偿金。

进一步思考：在处理工资扣减问题时，你需要保留好相关证据，如工资条、劳动合同、公司规章制度、沟通记录等，以便在需要时证明自己的权益。如果你对工资扣减问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。