结论：员工休育儿假期间扣绩效工资是否合法，需根据具体情况判断，但一般情况下，用人单位不得因员工休育儿假而扣减其绩效工资。以下从不同角度进行详细分析：
一、法律法规层面
育儿假的性质：
- 育儿假是法律赋予员工的一项权利，旨在保障员工在子女幼年时期有足够的时间进行照顾和陪伴。
- 根据相关法律法规，员工在育儿假期间应享受与正常工作期间相同的工资待遇，除非法律法规另有规定或劳动合同中有特别约定。
绩效工资的性质：
- 绩效工资是员工工资的一部分，通常与员工的工作表现、业绩等挂钩。
- 在员工休育儿假期间，由于员工并未实际参与工作，因此无法直接根据工作表现或业绩来评定绩效工资。但这并不意味着用人单位可以因此扣减员工的绩效工资。
法律法规的具体规定：
- 根据《劳动法》、《劳动合同法》以及相关地方性法规，用人单位在员工休育儿假期间，应保障员工的工资待遇不受影响。
- 具体来说，如果员工的绩效工资是其固定工资的一部分，且没有因员工休育儿假而发生实际工作表现的变动，那么用人单位不得扣减。
二、劳动合同与规章制度层面
劳动合同的约定：
- 如果劳动合同中明确规定了员工在休育儿假期间的工资待遇，包括绩效工资的支付方式和标准，那么用人单位应按照劳动合同的约定执行。
- 如果劳动合同中没有明确规定，或者规定与法律法规相冲突，那么应以法律法规为准。
用人单位的规章制度：
- 用人单位的规章制度不得违反法律法规的规定，也不得侵犯员工的合法权益。
- 如果用人单位的规章制度中规定了员工在休育儿假期间扣减绩效工资，且该规定与法律法规相冲突，那么该规定无效。
三、实际操作与建议
用人单位的操作：
- 用人单位在制定工资支付政策时，应充分考虑员工休育儿假的情况，确保员工的工资待遇不受影响。
- 如果用人单位确实需要调整员工在休育儿假期间的工资待遇，应与员工进行充分沟通，并征得员工的同意。
员工的权益保护：
- 如果员工发现用人单位在其休育儿假期间扣减了绩效工资，可以首先与用人单位进行协商，要求用人单位补发工资。
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或者通过法律途径维护自己的合法权益。
举例说明：假设某员工与用人单位签订的劳动合同中明确规定了其月工资包括基本工资和绩效工资两部分，且未对休育儿假期间的工资待遇作出特别约定。在该员工休育儿假期间，用人单位以其未实际工作为由扣减了绩效工资。这种情况下，用人单位的行为是违法的，因为劳动合同中并未规定休育儿假期间可以扣减绩效工资，且法律法规也未赋予用人单位这样的权利。
总结与建议：员工在休育儿假期间，用人单位一般不得扣减其绩效工资。如果用人单位有扣减行为，员工应首先与用人单位协商，协商无果的可以向劳动监察部门投诉或通过法律途径维权。如果你在这方面有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，可以直接向我咨询。