员工年休假期间扣绩效工资是否合法，主要取决于绩效工资的性质、公司规定以及相关法律法规，一般情况下是不合法的。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律角度：

   • 根据《职工带薪年休假条例》第二条，职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。这里的“工资收入”是一个广义的概念，通常包括基本工资、奖金、津贴以及绩效工资等各种形式的报酬。因此，从法律层面来看，绩效工资作为工资的一部分，在员工休年假时也应正常发放。

2. 绩效工资的性质：

   • 若绩效工资是根据员工的实际工作业绩、工作表现等考核指标来确定和发放的，且年假期间员工没有实际提供劳动、没有产生工作成果，那么从绩效工资的性质和考核逻辑来看，单位不发放绩效工资在特定情境下（如绩效考核周期与年假重合且绩效确实与年假期间无工作成果相关）可能有一定的合理性，但这并不意味着合法，除非公司规章制度或劳动合同中有明确且合法的规定。
   • 反之，如果绩效工资已成为员工工资的固定组成部分，或与公司规章制度、劳动合同中的约定挂钩，并非单纯根据工作业绩来发放，那么在年假期间，用人单位应当正常发放包含绩效工资在内的全额工资。

3. 公司规定与劳动合同：

   • 公司内部的规章制度及劳动合同是判断的重要依据。如果公司在其规章制度或劳动合同中明确规定了年休假期间绩效工资的计算和发放方式，且该规定不违反法律法规的强制性规定，员工有权要求公司按照这些规定执行。
   • 若公司没有相关规定或规定不明确，则需要结合绩效工资的性质及实际情况来判断。但无论如何，公司都不能以员工休年假为由，故意不发放绩效工资，以达到降低员工收入的目的，这种行为是不合法的。

4. 员工应对措施：

   • 员工对公司的做法有疑问或不满时，首先应查阅公司的相关规章制度或劳动合同，了解绩效工资的计算和发放方式。
   • 若无法解决问题，可以与用人单位进行沟通协商，明确表达自己的诉求和依据。
   • 协商不成时，可以向当地的劳动监察部门投诉或咨询律师寻求帮助，必要时可申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

总结来说，员工在年休假期间应享受与正常工作期间相同的工资待遇，包括绩效工资。如果用人单位无故扣除休年假员工的绩效工资，员工有权采取相应措施来维护自己的合法权益。如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。