商铺收取垃圾费在符合法律法规、政策规定，并经过合法程序的情况下是合法的。具体合法性取决于收费的依据、程序以及实际提供的服务。以下是对此问题的详细分析：
一、合法收费的依据与主体
物业服务企业收取：
- 合同约定：若商铺业主或租户与物业服务企业在物业服务合同中明确约定了垃圾处理服务的内容及收费标准，则物业服务企业按照合同约定收取垃圾费是合法的。这基于《中华人民共和国民法典》的相关规定，物业服务合同对业主具有法律约束力。
- 实际服务提供：即使合同未明确约定，但物业服务企业实际上为商铺提供了垃圾收集、运输、处理等服务，根据公平合理原则，也可在合理范围内收取费用。这同样基于《中华人民共和国民法典》中关于违约责任的规定。
政府相关部门或其他合法主体收取：
- 依法依规：政府相关部门或其他合法主体依据国家或地方的法律法规、政策规定，对商铺产生的垃圾进行集中处理，并按规定标准和程序收取垃圾处理费，属于合法的行政事业性收费或服务性收费。例如，《城市生活垃圾管理办法》就规定了城市生活垃圾处理实行收费制度。
二、非法收费的情形
- 未经授权或无合法依据：若收取垃圾费的主体没有合法授权，或收费标准、程序不符合法律法规和政策规定（如擅自设立收费项目、收费标准过高等），则这种收费行为是非法的。商铺有权拒绝缴纳，并可向相关部门投诉举报。这依据的是《中华人民共和国价格法》中关于不得违反法律、法规规定牟取暴利的规定。
三、判断合法性的关键要素
- 当地法律法规与政策文件：商铺应具体了解当地的法律法规和政策文件，以确定是否有明确规定商铺需要缴纳垃圾处理费。
- 收费的具体程序和依据：合法的收费应经过合法程序，如政府相关部门的公告、听证等。商铺应要求收费方出示相关依据和程序文件。
四、实际操作建议
- 查阅合同与法规：商铺应首先查阅与物业服务企业签订的合同，了解其中关于垃圾处理服务的约定。同时，查阅当地的城市生活垃圾管理办法或相关条例，了解当地的具体规定和要求。
- 咨询相关部门：若对收费有疑问或争议，商铺应积极与当地的环卫部门、物业公司或居委会等相关机构进行沟通，他们能够提供最准确的信息和指导。
- 保留证据：在缴费过程中，商铺务必保留好相关的缴费凭证和记录，如合同、收据、公告等，以备后续可能的争议解决之需。
举例说明：假设某商铺与物业服务企业签订的合同中明确约定了垃圾处理服务的内容及收费标准，且物业服务企业确实提供了相应的服务。那么，物业服务企业按照合同约定收取垃圾费就是合法的。反之，如果合同中没有约定，且物业服务企业未经商铺同意擅自收取垃圾费，或者收费标准过高且未经合法程序确定，那么这种收费行为就是非法的。
综上所述，商铺垃圾费的收取合法性需综合考虑收费依据、程序以及实际提供的服务。在符合法律法规、政策规定，并经过合法程序的情况下，垃圾费的收取是合法的。若存在任何疑问或争议，商铺应及时向我咨询以维护自身权益。