分居协议签订后，扶养费条款在符合法定条件的情况下仍然有效。以下从不同角度为你详细分析：

一、分居协议的法律性质与扶养费条款的效力

分居协议是夫妻双方在婚姻关系存续期间，就分居期间的相关事宜（包括但不限于财产分割、子女抚养、扶养费支付等）达成的书面协议。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，夫妻双方可以就婚姻关系存续期间所得的财产以及婚前财产的归属、管理、使用和处分等事项进行约定，该约定对双方具有法律约束力。虽然民法典未直接提及分居协议，但分居协议中的扶养费条款，本质上属于夫妻双方对婚姻关系存续期间经济安排的约定，只要该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，就应当认定为有效。

二、扶养费条款有效的具体条件

1. 双方自愿：分居协议及其中的扶养费条款必须是夫妻双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。
2. 内容合法：扶养费条款的内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，如不得约定一方完全放弃扶养权或要求另一方支付不合理的扶养费等。
3. 形式要件：虽然分居协议并非必须采用书面形式，但为了证明双方的真实意思和避免纠纷，建议采用书面形式，并由双方签字或盖章确认。

三、分居协议签订后扶养费条款可能失效的情形

1. 协议被撤销或变更：如果分居协议存在欺诈、胁迫等情形，受损害方有权请求人民法院或仲裁机构撤销或变更该协议，包括其中的扶养费条款。
2. 经济状况显著变化：如果支付扶养费的一方经济状况发生显著变化，如失业、重大疾病等，导致无法继续按照原协议支付扶养费，双方可以协商变更扶养费条款或通过法律途径解决。
3. 子女情况变化：如果分居协议中涉及子女抚养费，且子女情况发生显著变化（如子女成年、子女患病需要更多医疗费用等），双方也可以协商变更抚养费条款。

四、实际建议

1. 明确约定：在签订分居协议时，应明确约定扶养费的支付方式、支付时间、支付金额等具体事项，以避免后续纠纷。
2. 保留证据：支付扶养费的一方应保留好支付凭证（如银行转账记录、收据等），以证明自己已按照协议履行了支付义务。
3. 及时沟通：如果双方的经济状况或子女情况发生变化，应及时沟通并协商变更分居协议中的相关条款。

举例说明：假设甲和乙是夫妻，双方签订了分居协议，约定甲每月支付乙扶养费5000元。后来，甲因失业导致经济状况显著恶化，无法继续按照原协议支付扶养费。此时，甲可以与乙协商变更扶养费条款，如降低支付金额或暂停支付等。如果双方无法达成一致意见，甲可以通过法律途径解决纠纷。

如果你在分居协议或扶养费方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。