不同的法人但互相有持股，并不直接等同于属于同一个机构。以下从几个角度进行详细分析：

1. 法人的独立性：

   • 法人，作为法律上的实体，具有独立的法律地位和财产权益。每个法人都是独立的个体，拥有自己的名称、组织机构、住所和财产等。
   • 即便不同的法人之间存在持股关系，这并不意味着它们就失去了各自的独立性。持股关系只是表明它们之间存在经济上的联系或控制关系，但并不改变它们各自作为独立法人的法律地位。

2. 持股关系的性质：

   • 持股关系可以是直接的，也可以是间接的。直接持股是指一个法人直接持有另一个法人的股份；间接持股则可能通过多层结构来实现，如一个法人持有另一个法人的控股公司的股份，从而间接控制该法人。
   • 无论持股关系是直接还是间接，它都不足以证明两个法人属于同一个机构。持股关系更多地是反映了它们之间的经济联系或控制关系，而非法律上的同一性。

3. 机构归属的判断标准：

   • 判断两个法人是否属于同一个机构，不能仅凭它们之间是否存在持股关系。而需要综合考虑多个因素，如它们的组织结构、管理方式、业务范围、财务状况等。
   • 如果两个法人在组织结构、管理方式、业务范围等方面存在高度的一致性或重合性，且它们的财务状况也紧密相连，那么才有可能认为它们属于同一个机构。但即便如此，也需要具体的法律证据和事实依据来支持这一判断。

4. 法律后果与责任：

   • 即便两个法人之间存在持股关系，它们在法律上仍然是独立的个体。这意味着它们各自需要承担自己的法律责任和义务。
   • 如果一个法人因为违法行为而承担法律责任，这并不会自动延伸到另一个法人身上，除非有证据表明另一个法人也参与了该违法行为或从中受益。

建议：

• 在处理涉及不同法人但互相有持股的法律问题时，应首先明确每个法人的独立法律地位和责任。
• 不要仅凭持股关系就轻易判断两个法人属于同一个机构，而需要综合考虑多个因素并进行深入的法律分析。
• 如有需要，可以寻求专业律师的帮助，以确保你的权益得到充分保护。

希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他关于公司法务的问题，欢迎直接向我咨询。