农民合同工退休时，其工龄是计算在内的。以下是对这一问题的详细解释：

1. 工龄的定义与计算：

   • 工龄，通常指的是职工以工资收入为生活资料的全部或主要来源的工作时间。在计算退休金、享受带薪年休假、病假、产假、探亲假等福利待遇时，工龄是一个重要的考量因素。
   • 对于农民合同工而言，只要他们与用人单位签订了劳动合同，并按照合同约定提供了劳动，那么这段时间就应当被计入工龄。

2. 农民合同工的特殊性：

   • 农民合同工与城镇职工在身份上可能存在差异，但在劳动合同关系上，他们享有同等的权利和义务。因此，在计算工龄时，农民合同工不应受到歧视或特殊对待。
   • 实际上，随着劳动法律法规的完善，农民合同工的权益得到了更好的保障。他们的工龄计算、社会保险缴纳等方面都与城镇职工趋于一致。

3. 工龄计算的具体实践：

   • 在实际操作中，用人单位应当为农民合同工建立完整的档案，记录他们的工作时间、工资待遇等信息。这些档案是计算工龄的重要依据。
   • 当农民合同工达到退休年龄时，用人单位或社会保险机构会根据他们的工龄、缴费年限等因素来计算退休金。工龄越长，退休金通常也会越高。

4. 可能存在的误区与澄清：

   • 有人可能认为农民合同工由于身份特殊，其工龄不被计算。但实际上，这种观念是过时的，也不符合现行法律法规的规定。
   • 农民合同工应当积极了解自己的权益，包括工龄计算、社会保险缴纳等方面。如果发现用人单位存在违法行为，如未计算工龄、未缴纳社会保险等，应当及时向相关部门投诉或寻求法律援助。

建议：

• 对于农民合同工而言，保留好与用人单位签订的劳动合同、工资单等证据材料，以便在需要时证明自己的工龄和权益。
• 如果对工龄计算或退休金待遇有疑问，可以向当地的社会保险机构或劳动监察部门咨询，了解具体的政策和规定。
• 在遇到劳动纠纷时，及时寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。

总之，农民合同工退休时，其工龄是计算在内的。他们应当了解自己的权益，并积极维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。