事业单位乱扣工资，主要会面临以下法律后果：
补发工资及经济补偿：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，事业单位作为用人单位，必须按照劳动合同的约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。如果事业单位乱扣工资，劳动者有权要求补发被扣的工资，并且根据具体情况，事业单位可能还需要支付一定的经济补偿。
行政处罚：
- 事业单位乱扣工资的行为，如果违反了相关劳动法律法规，劳动行政部门有权对其进行行政处罚。这可能包括警告、罚款等措施，具体处罚力度会根据违法情节的严重程度来确定。
民事赔偿：
- 如果事业单位乱扣工资给劳动者造成了经济损失，如影响了劳动者的生活、导致劳动者无法按时偿还债务等，劳动者还有权要求事业单位进行民事赔偿。赔偿的范围将根据实际损失来确定，可能包括直接经济损失和间接经济损失。
影响单位信誉和形象：
- 事业单位乱扣工资的行为，一旦被曝光或引发劳动争议，将对单位的信誉和形象造成负面影响。这可能导致单位在招聘、合作等方面遇到困难，甚至影响单位的正常运营和发展。
从劳动者角度，如果遇到事业单位乱扣工资的情况，可以采取以下措施：
与单位协商：
- 首先，劳动者可以尝试与事业单位进行协商，了解扣工资的具体原因，并要求单位提供合理的解释和证据。如果单位能够给出合理的解释，并且劳动者认可，那么问题可能得到妥善解决。
向劳动行政部门投诉：
- 如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动行政部门投诉。劳动行政部门将依法对投诉进行调查处理，并保护劳动者的合法权益。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 如果劳动行政部门的处理结果不能满足劳动者的需求，或者单位拒绝执行劳动行政部门的处理决定，劳动者还可以申请劳动仲裁或提起诉讼。通过法律途径来维护自己的合法权益。
举例说明：
假设某事业单位以“工作表现不佳”为由，扣除了某员工一个月的工资。但该员工认为自己的工作表现并无问题，且单位未能提供合理的扣工资依据。在这种情况下，该员工可以先与单位进行协商，要求单位补发工资。如果协商无果，该员工可以向当地的劳动行政部门投诉，要求劳动行政部门介入调查。如果劳动行政部门的处理结果仍不能满足该员工的需求，该员工还可以申请劳动仲裁或提起诉讼，通过法律途径来维护自己的合法权益。
总之，事业单位乱扣工资是违法行为，将面临法律后果。劳动者在遇到此类情况时，应积极维护自己的合法权益，通过合法途径来解决问题。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。