核心结论：入职两年才签订合同，您仍然有权申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

详细分析：

1. 法律背景：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系，并应当订立书面劳动合同。如果用人单位未在用工之日起一个月内与劳动者订立书面劳动合同，那么从第二个月起，用人单位需要向劳动者支付双倍工资作为赔偿。这一规定旨在保护劳动者的权益，确保劳动合同的及时签订。

2. 您的具体情况：

   • 您入职两年后才签订合同，这意味着在入职后的前一年十一个月里，用人单位未与您签订书面劳动合同。根据法律规定，您有权要求用人单位支付这期间（即十一个月）的双倍工资作为赔偿。

3. 劳动仲裁的申请：

   • 劳动仲裁是解决劳动争议的一种有效方式。如果您认为用人单位的行为侵犯了您的合法权益，您可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在申请仲裁时，您需要提供相关证据来证明您的主张，如工资单、工作证、考勤记录等，以证明您与用人单位之间存在劳动关系以及用人单位未及时签订劳动合同的事实。

4. 可能的法律后果：

   • 如果劳动争议仲裁委员会认定您的主张成立，那么用人单位将需要支付您双倍工资的赔偿，并可能面临其他法律责任，如补签劳动合同、改善劳动条件等。同时，这也将对用人单位的声誉和信誉产生负面影响。

5. 建议与行动：

   • 我建议您尽快收集相关证据，并咨询专业的劳动法律师（当然，您可以直接向我咨询，我专注于刑事辩护和合同纠纷领域，对劳动工伤问题也有深入的了解），以了解具体的法律程序和策略。在律师的指导下，您可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。

进一步思考：

• 在申请仲裁前，您也可以尝试与用人单位进行协商，看是否能够达成和解协议。如果协商无果，再考虑申请仲裁也不迟。
• 另外，值得注意的是，劳动仲裁的时效期间为一年，从您知道或者应当知道权利被侵害之日起计算。因此，请务必在时效期间内提出仲裁申请，以免丧失维权的机会。

总之，入职两年才签订合同并不影响您申请劳动仲裁的权利。如果您认为自己的权益受到了侵害，请勇敢站出来，通过法律途径维护自己的合法权益。