关于抚养费1000元三个月未付，违约金赔300是否合法的问题，这主要取决于双方在协议或判决中的具体约定以及相关法律法规的规定。以下是我从不同角度为你进行的分析：

1. 协议或判决中的约定：

   • 如果双方在离婚协议或法院判决中明确约定了抚养费的支付金额、支付时间以及逾期支付的违约金数额，那么只要该约定不违反法律法规的强制性规定，就是合法有效的。在这种情况下，如果一方三个月未支付抚养费，按照约定支付300元违约金是合法的。

2. 法律法规的规定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，离婚后，子女由一方直接抚养的，另一方应当负担部分或者全部抚养费。负担费用的多少和期限的长短，由双方协议；协议不成的，由人民法院判决。
   • 关于违约金，虽然民法典没有直接规定抚养费逾期支付的违约金标准，但通常认为，违约金应当合理，不应过高或过低。如果双方约定的违约金数额明显过高或过低，法院可能会根据实际情况进行调整。
   • 在你提到的情况中，如果1000元是每月的抚养费，三个月未付则是3000元，违约金为300元，这通常被认为是合理的，因为违约金数额并未超过未支付抚养费总额的合理比例。

3. 实际操作的考量：

   • 除了法律层面的考量，实际操作中还需要考虑双方的经济状况、支付能力以及子女的实际需要等因素。如果一方确实因为经济困难而无法按时支付抚养费，另一方可以与其协商延期支付或分期支付，而不是直接要求支付违约金。
   • 如果双方无法就抚养费的支付问题达成一致，可以通过法律途径解决，如向法院申请强制执行或提起诉讼要求支付抚养费及违约金。

总结与建议：

• 如果双方在协议或判决中明确约定了抚养费及违约金的支付方式和数额，且该约定合法有效，那么按照约定支付违约金是合法的。
• 如果双方没有约定或约定不明确，或者违约金数额明显不合理，可以通过协商或法律途径解决。
• 在实际操作中，建议双方保持沟通，尽量通过协商解决抚养费支付问题，以维护子女的合法权益和双方的和谐关系。

如果你有进一步的疑问或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供更详细的解答。