结论：在公安机关和检察院作出不予立案决定后，控诉人自诉到法院且法院最终判有罪的情况下，控诉人一般不能直接对公安机关或检察院进行追责，但可以通过特定途径反映问题或寻求救济。以下是对此问题的详细分析：

1. 公安机关和检察院不予立案的性质：

   • 公安机关和检察院在接到控诉后，会进行初步审查，以决定是否立案。如果认为控诉不成立或证据不足，可能会作出不予立案的决定。
   • 不予立案决定是公安机关和检察院根据现有证据和法律规定作出的判断，它并不直接等同于对案件的最终定性。

2. 自诉到法院的过程：

   • 如果控诉人对公安机关或检察院的不予立案决定不服，可以选择向法院提起自诉。
   • 自诉案件需要控诉人自行收集证据，并承担举证责任。法院会根据控诉人提供的证据和法律规定，对案件进行审理并作出判决。

3. 法院判有罪后的追责问题：

   • 如果法院最终判决被告人有罪，这并不意味着公安机关或检察院的不予立案决定是错误的或需要被追责。
   • 法院的判决是基于其审理过程中认定的证据和事实，与公安机关或检察院的初步审查决定是独立的。
   • 一般情况下，控诉人不能直接对公安机关或检察院进行追责。因为不予立案决定是公安机关和检察院在特定阶段根据现有信息作出的判断，而法院的判决是在更全面、深入的审理后作出的。

4. 可能的救济途径：

   • 如果控诉人认为公安机关或检察院在不予立案过程中存在违法行为或不当行为，可以通过向相关部门投诉、申请复议或提起行政诉讼等途径来寻求救济。
   • 例如，如果控诉人认为公安机关在不予立案时未依法履行职责，可以向其上级机关或同级人民检察院投诉；如果认为检察院的不予立案决定违法，可以向上一级人民检察院申请复议或提起行政诉讼（但需注意，对检察院的复议决定通常不能直接提起行政诉讼，而是可能通过其他途径如申诉等解决）。

5. 特殊情况下的考虑：

   • 在极少数情况下，如果公安机关或检察院的不予立案决定确实存在严重错误或违法行为，且该错误或行为直接导致了案件的错误处理或控诉人的合法权益受到严重损害，那么控诉人可能有机会通过特定程序（如国家赔偿程序）来寻求一定的补偿或救济。但这需要满足严格的条件和程序要求。

建议：如果您作为控诉人遇到了类似情况，建议首先保持冷静，并仔细分析案件的具体情况和证据。如果您认为公安机关或检察院的不予立案决定存在疑问或不当之处，可以咨询专业律师以了解您的权利和可能的救济途径。同时，您也可以积极收集证据并准备自诉材料，以便在必要时向法院提起自诉。如果您有任何法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。