政府工作雇员违纪的应对需分情况处理，核心原则是依据违纪性质、情节严重程度及单位规章制度，采取合法合规的处置措施。具体可从以下角度展开分析：

1. 违纪行为的初步认定与调查

• 程序合法性：单位需依据《公务员法》《事业单位人事管理条例》或内部规章制度（如《员工手册》）启动调查程序，确保调查过程有书面记录、证人证言等证据支撑，避免程序瑕疵导致后续处置无效。
• 证据固定：收集违纪证据（如监控录像、书面文件、同事证言等），确保证据真实、关联、合法，避免使用非法手段获取证据（如窃听、胁迫）。
• 雇员陈述权：根据《行政处罚法》或单位规定，雇员有权在调查阶段陈述事实、申辩，单位需记录并复核其陈述内容。

2. 违纪行为的分类处置

• 一般违纪（如迟到早退、轻微工作失误）：
  单位可依据规章制度给予警告、记过、扣发奖金等处分，需书面通知雇员并留存档案。若雇员对处分有异议，可申请内部复核或通过劳动仲裁维权。
• 严重违纪（如贪污受贿、泄露国家秘密、严重失职）：
  单位可依据《公务员法》《监察法》或《刑法》相关条款，直接解除劳动合同或移送纪检监察机关处理。若涉及刑事犯罪，单位需配合司法机关调查，雇员可能面临刑事责任。
• 特殊情形（如雇员怀孕、患病等）：
  根据《劳动合同法》第42条，单位不得以非法定理由解除劳动合同，但严重违纪（如故意犯罪）除外。需严格区分“不能胜任工作”与“严重违纪”，避免违法解除。

3. 雇员的救济途径

• 内部申诉：雇员可向单位工会、纪检监察部门提出申诉，要求重新审查处分决定。
• 劳动仲裁/诉讼：若雇员认为处分违法，可在收到处分决定后60日内申请劳动仲裁，或直接向法院提起行政诉讼（针对行政机关处分）或民事诉讼（针对事业单位或企业雇员）。
• 刑事辩护：若雇员被移送司法机关，可委托律师进行刑事辩护，争取从轻、减轻或免除处罚。

4. 单位的合规建议

• 完善制度：制定明确的《违纪行为处理办法》，列明违纪情形、处分标准及程序，避免“口袋条款”。
• 培训与告知：定期组织雇员学习规章制度，确保其知晓违纪后果，保留培训记录作为证据。
• 法律审查：处分决定前咨询法律顾问，确保程序合法、证据充分，降低败诉风险。

总结：政府工作雇员违纪的应对需兼顾“程序正义”与“实体正义”，单位需依法依规处置，雇员也需通过合法途径维权。若涉及具体案件，可进一步提供细节，我将结合法律条文与实务经验为您详细分析。