在刑事诉讼中，负责排除非法证据的机关主要包括侦查机关、检察机关和审判机关，同时当事人及其辩护人、诉讼代理人也有权申请排除非法证据。以下是对这一问题的详细分析：
一、侦查机关（公安机关）
义务内容：
- 侦查机关在侦查过程中，应严格遵守法律规定，不得采用非法方法收集证据。
- 若发现已收集的证据是非法取得的，应当主动予以排除，不得将其作为提请批准逮捕或移送审查起诉的依据。
实际操作：
- 例如，若公安机关通过刑讯逼供取得犯罪嫌疑人的供述，该供述不应作为侦查成果用于后续程序，而应被主动排除。
二、检察机关（人民检察院）
义务内容：
- 在审查逮捕阶段，若发现公安机关提请批准逮捕的证据中存在非法证据，应依法作出不批准逮捕的决定，并书面说明理由。
- 在审查起诉阶段，应对侦查机关收集的证据进行全面审查，对于非法取得的证据，应依法予以排除，不得作为提起公诉的依据。
- 同时，检察院有义务监督侦查活动的合法性，如发现侦查人员以非法方法收集证据，应提出纠正意见；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
实际操作：
- 检察院在审查证据时，会严格审查证据的合法性，确保提起公诉的证据均合法有效。若发现非法证据，会依法予以排除。
三、审判机关（人民法院）
义务内容：
- 在法庭审判过程中，对涉及非法证据排除的申请应进行审查。
- 若经过法庭审理，确认或不能排除存在法律规定的以非法方法收集证据情形的，对相关证据应予以排除，不得作为定案的根据。
- 法院不仅应对被告人及其辩护人提出的非法证据排除申请进行审查处理，而且在法庭审理过程中，如发现可能存在非法证据的，也应主动进行调查核实。
实际操作：
- 法院在审判过程中，会确保审判的公正性和证据的合法性。若发现非法证据，会严格排除，不得作为判决依据。
四、当事人及其辩护人、诉讼代理人的权利
权利内容：
- 当事人（特别是犯罪嫌疑人、被告人）及其辩护人、诉讼代理人有权申请人民法院对以非法方法收集的证据依法予以排除。
- 申请排除非法证据时，应当提供相关线索或者材料，如时间、地点、实施非法取证的人员等，以启动对证据合法性的调查程序。
实际操作：
- 在刑事诉讼中，若当事人或其辩护人、诉讼代理人认为某证据为非法取得，可向法院提出排除非法证据的申请，并提供相关线索或材料。法院在审查后，会依法作出是否排除的决定。
五、法律依据
- 《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十六条：采用刑讯逼供等非法方法收集的犯罪嫌疑人、被告人供述和采用暴力、威胁等非法方法收集的证人证言、被害人陈述，应当予以排除。收集物证、书证不符合法定程序，可能严重影响司法公正的，应当予以补正或者作出合理解释；不能补正或者作出合理解释的，对该证据应当予以排除。在侦查、审查起诉、审判时发现有应当排除的证据的，应当依法予以排除，不得作为起诉意见、起诉决定和判决的依据。
- 《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十八条：法庭审理过程中，审判人员认为可能存在本法第五十六条规定的以非法方法收集证据情形的，应当对证据收集的合法性进行法庭调查。当事人及其辩护人、诉讼代理人有权申请人民法院对以非法方法收集的证据依法予以排除。申请排除以非法方法收集的证据的，应当提供相关线索或者材料。
在处理涉及非法证据排除的问题时，各机关应严格遵守法律规定，确保证据的合法性，从而维护诉讼的公正、公平和人权保障。如果您在房产纠纷、拆迁安置、合同纠纷、交通事故、公司事务、行政纠纷或经济纠纷等领域遇到法律问题，欢迎直接向我咨询。