结论：不写日志扣钱这样的制度是否合法，需根据具体情况判断，若该制度符合法律法规、不违反公序良俗且经过合法程序制定，则可能是合法的；反之，则可能不合法。以下从多个角度进行分析：
一、制度合法性的基本判断标准
符合法律法规：
- 任何公司制度，包括关于日志记录和扣钱的制度，都必须符合国家法律法规的规定。例如，不能违反《劳动法》、《劳动合同法》等相关法律法规中关于工资支付、劳动纪律、员工权益保护等方面的规定。
- 如果制度中规定的扣钱行为没有法律依据，或者扣钱金额、扣钱条件等不符合法律法规的规定，那么该制度就是不合法的。
不违反公序良俗：
- 制度内容应当符合社会公德和职业道德，不得违背公序良俗。例如，不能因为员工未写日志就采取过于严厉的惩罚措施，如扣除全部工资或进行人身攻击等。
经过合法程序制定：
- 公司制度应当经过民主程序制定，并告知员工。如果制度未经合法程序制定，或者未告知员工，那么该制度对员工不具有约束力。
二、具体情境下的合法性分析
日志记录与工作绩效的关系：
- 如果日志记录是员工工作的一部分，且公司能够证明日志记录与工作绩效有直接关联，那么公司可能有权根据员工未写日志的情况进行一定的管理措施，包括扣钱。但这种扣钱行为必须符合法律法规的规定，且扣钱金额应当合理。
- 示例：如果公司规定员工每天需提交工作日志，且日志内容与工作绩效评估直接相关，员工未提交日志导致公司无法准确评估其工作绩效，公司可能根据内部规定扣除一定比例的绩效工资。但这种扣除必须事先在劳动合同或公司规章制度中明确约定，且扣除比例需合理。
扣钱行为的合理性与合法性：
- 扣钱行为必须合理且合法。合理性体现在扣钱金额应当与员工未写日志的行为造成的损失相当；合法性则体现在扣钱行为必须符合法律法规的规定，如不得违反最低工资标准、不得随意扣除员工工资等。
- 示例：如果公司因为员工未写日志而扣除其全部工资，这种行为显然是不合理的，也是不合法的。因为扣除全部工资远远超过了员工未写日志可能给公司造成的损失，且违反了最低工资标准的规定。
员工权益的保护：
- 在制定和执行相关制度时，公司应当充分考虑员工的权益保护。如果制度对员工权益造成不当侵害，员工有权依法维护自己的权益。
- 建议：公司可以设立申诉机制，允许员工对扣钱行为提出异议和申诉。同时，公司应当定期对制度进行审查和更新，确保其符合法律法规的规定和员工权益保护的要求。
三、法律建议
对于公司：
- 在制定和执行关于日志记录和扣钱的制度时，务必确保制度符合法律法规的规定，不违反公序良俗，且经过合法程序制定。
- 扣钱行为应当合理且合法，扣钱金额应当与员工未写日志的行为造成的损失相当。
- 设立申诉机制，允许员工对扣钱行为提出异议和申诉。
对于员工：
- 如果认为公司的扣钱行为不合法或不合理，可以与公司进行沟通协商，要求公司改正。
- 如果沟通协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，依法维护自己的权益。
有问题可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。