结论：淘宝卖家只开普通发票而不开增值税发票是否合法，需分情况讨论，具体如下：

1. 卖家是否具备开具增值税发票的资格
   根据《增值税暂行条例》及实施细则，只有办理了税务登记并认定为一般纳税人的企业，才有资格开具增值税专用发票。若卖家是小规模纳税人或未办理税务登记的个体工商户，则只能开具普通发票。此时，卖家行为合法，但您作为购买方若需要增值税专用发票用于抵扣税款，可要求卖家到税务机关代开（小规模纳税人可代开3%征收率的专票）。

2. 卖家具备开票资格但拒绝开具
   若卖家是一般纳税人，却以各种理由拒绝开具增值税专用发票（如“系统故障”“政策限制”等），则属于违法行为。根据《发票管理办法》第十九条，销售方必须按照购买方要求开具发票，不得以任何理由拒开。此时，您可向当地税务机关举报（拨打12366或通过电子税务局投诉），税务机关将责令卖家改正，并可能对其处以罚款。

3. 交易性质是否允许开具增值税发票
   若交易本身属于免税项目（如农业生产者销售自产农产品）、简易计税项目（如销售旧货），或购买方用于个人消费（非生产经营），则卖家无需开具增值税专用发票。此时，卖家开具普通发票合法，但您需确认交易是否符合免税/简易计税条件，避免因误解产生纠纷。

行动建议：

• 首先确认卖家是否为一般纳税人（可通过淘宝店铺资质、税务登记证或要求卖家提供证明查询）；
  
• 若卖家应开而拒开专票，可保留聊天记录、订单截图等证据，向税务机关投诉；
  
• 若交易确实不符合开专票条件，可与卖家协商通过其他方式补偿（如降价），或接受普票。
  

如有进一步疑问（如具体投诉流程、证据收集技巧），欢迎直接向我咨询。