工程质保金的比例一般不得高于工程价款结算总额的3%，因此，工程质保金不可以是5%（除非合同有特别约定且该约定不违反法律法规的强制性规定，但通常情况下5%的比例是高于法定上限的）。以下是对此问题的详细分析：
一、法律规定
根据2017年修订后的《建设工程质量保证金管理办法》，发包人应按照合同约定方式预留保证金，且保证金总预留比例不得高于工程价款结算总额的3%。这一规定旨在规范建设工程质量保证金的管理，确保工程在缺陷责任期内的维修责任得以落实。
二、合同约定与实际操作
合同约定：
- 发包人与承包人应在合同中明确约定保证金的预留方式及比例。若合同中没有约定或约定不明确，则应遵循《建设工程质量保证金管理办法》中的规定执行。
- 如果合同中有特别约定，如以银行保函替代预留保证金，那么保函的金额同样不得超过工程价款结算总额的3%。
实际操作中的灵活性：
- 尽管办法规定了最高的保证金预留比例，但具体的预留比例可能会因工程类型、合同条款以及当地的具体规定而有所调整。不过，这种调整通常需要在法律法规允许的范围内进行，且不得违反法律法规的强制性规定。
三、法律后果与建议
法律后果：
- 如果发包人预留的质保金比例超过了工程价款结算总额的3%，那么该行为可能构成违法，承包人有权要求发包人按照法定比例进行调整或退还多余部分。
- 同时，发包人也可能因此面临行政处罚或民事赔偿等法律责任。
建议：
- 在实际操作中，建议发包人与承包人参照相关的法律法规、合同条款以及地方规定，共同确定合理的质保金比例。
- 如果双方对质保金比例存在争议或疑问，可以寻求专业法律帮助以确保合法权益得到妥善保护。例如，可以向我咨询相关法律问题，我会根据具体情况提供详细的法律建议和解决方案。
四、特殊情况说明
- 在某些特殊情况下，如合同双方有特别约定且该约定不违反法律法规的强制性规定时，质保金比例可能会高于3%。但这种情况较为罕见，且需要严格的法律审查和合规性评估。因此，在大多数情况下，工程质保金的比例应遵循法定上限3%的规定。