工程质保金的比例并非固定为3%或5%，而是根据具体工程类型、合同约定及法律法规要求来确定，但常见比例为3%。以下是对此问题的详细分析：

一、法律法规规定

根据《建设工程质量保证金管理办法》（建质[2017]138号）第七条的规定：

• 发包人应按照合同约定方式预留保证金，保证金总预留比例不得高于工程价款结算总额的3%。
• 合同约定由承包人以银行保函替代预留保证金的，保函金额同样不得高于工程价款结算总额的3%。

这一规定为工程质保金的比例设定了上限，即不得超过工程价款结算总额的3%。

二、实际执行情况

1. 常见比例：

   • 在实际操作中，工程质量保证金的比例通常为工程总价款的3%。这一比例既符合法律法规的要求，也能在一定程度上保障发包人的权益。

2. 特殊情况：

   • 对于某些特殊类型的工程项目，如基础设施工程、大型公共建筑等，由于工程风险较高，发包人可能会与承包人协商确定更高的保证金比例，如5%。但这种情况需要双方在合同中明确约定，并且不得超过法律法规规定的上限（在此情况下，上限仍为3%的法定限制，若地方或行业有更高要求且不违反上位法，则以具体规定为准，但通常不会直接突破3%的法定上限作为普遍标准，5%更多是基于双方特别约定且可能伴随其他保障措施）。
   • 在一些政府投资项目中，为了加强对工程质量的监管和保障，可能会要求承包人缴纳一定比例的工程质量保证金，具体比例也会根据项目特点和实际情况来确定，但同样需要遵守相关法律法规的规定。

三、合同约定的重要性

• 无论工程质保金的比例如何确定，合同约定都是关键。双方应在合同中明确约定工程质保金的比例、支付方式、返还条件等条款，以避免后续产生纠纷。
• 如果合同中没有明确约定工程质保金的比例，那么应参照相关法律法规的规定执行，即通常不得超过工程价款结算总额的3%。

四、建议

• 对于发包人：在签订合同时，应明确约定工程质保金的比例和支付方式，并确保该比例符合法律法规的规定。同时，应加强对工程质量的监管和验收工作，确保工程质量符合合同要求。
• 对于承包人：在签订合同时，应仔细审查合同中关于工程质保金的条款，确保自己的权益得到保障。如果认为合同中的工程质保金比例过高或存在其他不合理条款，应及时与发包人协商修改或寻求法律援助。

如果您在工程质保金方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。