结论：经商过程中因非法所得200万被留置并没收，是否会有案底取决于具体案件的处理结果，若最终被法院判定有罪，则会有案底；若未被判定有罪或案件被撤销、不起诉，则通常不会有案底。

详细分析：

1. 留置与没收非法所得的性质：

   • 留置是监察机关在调查涉嫌严重职务违法或职务犯罪时，对被调查人采取的一种限制人身自由的措施。它本身并不直接决定是否有案底，而是调查过程中的一个环节。
   • 没收非法所得是对违法所得的一种法律制裁，旨在剥夺违法者通过非法手段获得的利益。没收非法所得本身也不直接决定是否有案底，而是对违法行为的一种处理结果。

2. 案底的形成：

   • 案底，通常指的是犯罪记录，即某人因犯罪被法院判定有罪后留下的记录。这种记录会保存在公安机关的档案中，对个人的社会信用、就业、出国等方面可能产生一定影响。
   • 若在经商过程中，因非法所得200万被留置并最终被法院判定有罪（如构成贪污罪、受贿罪等），则会有案底。
   • 若在调查过程中，发现证据不足或不存在犯罪事实，案件被撤销或不起诉，或者虽然存在违法行为但未达到犯罪程度，则通常不会有案底。

3. 可能涉及的法律条款：

   • 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，贪污罪、受贿罪等职务犯罪的构成要件包括主体、客体、主观方面和客观方面。若经商过程中非法所得的行为符合这些构成要件，且数额达到犯罪标准，则可能构成犯罪。
   • 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，案件的处理结果包括有罪判决、无罪判决、撤销案件、不起诉等。这些处理结果将直接影响是否有案底的形成。

4. 建议与后续行动：

   • 若您或您认识的人正面临此类情况，建议尽快咨询专业律师，了解案件的具体情况和可能的法律后果。
   • 律师将根据案件事实、证据和法律规定，为您提供专业的法律意见和辩护策略，以维护您的合法权益。
   • 同时，您也应积极配合调查机关的工作，如实陈述事实，提供相关证据，以便案件能够得到公正、合理的处理。

总结：经商过程中因非法所得200万被留置并没收，是否会有案底取决于案件的具体处理结果。若最终被法院判定有罪，则会有案底；若未被判定有罪或案件被撤销、不起诉，则通常不会有案底。因此，建议您或您认识的人尽快咨询专业律师，了解案件情况并寻求法律帮助。