关于“商人留置出来是否有案底”的问题，这需要从法律程序和留置措施的性质来详细解释。

首先，留置是纪检监察机关在调查涉嫌严重职务违法或职务犯罪时，对被调查人采取的一种限制人身自由的强制措施。它的主要目的是为了保障调查工作的顺利进行，防止被调查人逃匿、串供或毁灭证据等。留置并不等同于刑事判决，而是调查过程中的一个环节。

接下来，我们分析“案底”的概念。案底，通常指的是个人因犯罪行为被司法机关依法处理后留下的记录，这种记录一般会在个人的刑事档案中体现，并可能对个人未来的某些权益（如就业、出国等）产生影响。

现在，我们回到问题本身：商人留置出来是否有案底？

1. 如果留置后未发现犯罪行为：如果纪检监察机关在留置期间调查后，未发现被留置的商人存在犯罪行为，或者证据不足无法定罪，那么该商人被释放后，不会留下案底。因为留置本身并不构成犯罪记录，它只是调查过程中的一个措施。

2. 如果留置后发现犯罪行为并定罪：如果调查发现被留置的商人存在犯罪行为，并且经过司法程序被定罪，那么该商人会留下案底。因为此时，他已经因为犯罪行为被司法机关依法处理，并留下了相应的刑事记录。

以您提供的参考信息为例，案例中涉及的是公职人员和行贿人的留置及后续处理。如果商人（如行贿人张某某）被留置后，经调查发现存在行贿等犯罪行为，并被司法机关定罪，那么他就会留下案底。反之，如果调查未发现其犯罪行为，或者证据不足无法定罪，则不会留下案底。

综上所述，商人留置出来是否有案底，取决于留置期间调查的结果以及后续司法程序的处理。如果未发现犯罪行为或证据不足无法定罪，则不会留下案底；如果发现犯罪行为并被定罪，则会留下案底。