非法经营和非法储存是否会留案底，这主要取决于行为的性质及其法律后果。以下是对此问题的详细分析：
不会留案底的情况：
- 行政处罚：如果非法经营或非法储存行为仅违反了行政法规，并未触及刑法，那么通常会受到如罚款、没收违法所得、暂扣或吊销相关证件等行政处罚。这种行政处罚记录并不会在个人刑事档案中留下，即不会形成通常所说的“案底”。此类记录主要在行政机关内部留存，对大多数非特定领域的社会活动和发展影响相对较小。
- 治安拘留但不构成犯罪：虽然公安机关可能对某些非法经营或非法储存行为给予治安拘留处罚，但这种记录在性质上仍属于行政处罚范畴，并不等同于刑事犯罪记录。因此，这种情况同样不会留下案底。但需要注意的是，该记录在公安机关长期保留，可能对报考公务员及特殊部门雇员的政审环节产生不利影响。
会留案底的情况：
- 构成犯罪：当非法经营或非法储存行为情节严重，触犯刑法时，就会留下案底。例如，非法经营行为可能涉及非法经营罪，非法储存行为可能涉及危险物品肇事罪或其他相关刑事犯罪。一旦经法院审判被认定构成犯罪，个人就会有犯罪记录，即留下案底。这种情况下，案底将对个人的诸多方面产生深远影响，包括但不限于就业（特别是某些行业、岗位明确限制有犯罪记录人员入职）、参军、报考公务员以及子女报考军警院校政审等。
总结与建议：
- 为避免不必要的法律风险和社会影响，建议严格遵守相关法律法规，不从事非法经营或非法储存活动。
- 如果已经涉嫌非法经营或非法储存行为，应积极配合调查，争取从轻或减轻处理。
- 如有任何疑问或需要帮助，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见和指导。
案底是永久性的记录，不会随着时间的推移而自动消除。因此，在从事任何经营活动或储存物品时，都应确保其合法性与合规性，以避免留下案底对个人和社会造成不良影响。