核心结论：针对合同已约定单价和总金额且已开票，后续又需开票需签订补充协议的情况，补充协议应重点明确新增开票的原因、金额、与原合同的关联、税务处理及双方权利义务等内容，以下为具体撰写要点和示例条款。

撰写要点

1. 明确新增开票的原因：在补充协议中清晰说明为何在原合同基础上需要再次开票，比如是因合同履行过程中出现了额外的服务或货物供应、价格调整等合理原因。这是为了避免后续可能出现的关于开票合理性的争议。
2. 确定新增开票的金额：详细准确地列出新增开票所对应的金额，该金额应与实际新增的业务或交易相符。同时，要明确该金额是否包含税费，若包含，需注明税率及税额的计算方式。
3. 说明与原合同的关系：阐述新增开票部分与原合同的关联，例如是原合同的补充、扩展，还是对原合同中某些条款的变更等。这有助于确定整个交易的完整性和一致性，以及在法律上对合同整体的理解和适用。
4. 税务处理条款：由于涉及开票，税务问题是不可忽视的重要方面。补充协议中应明确双方在税务方面的责任和义务，如发票的开具时间、开具方式、抵扣规则等，确保符合国家税收法律法规的要求。
5. 双方权利义务的明确：除了上述与开票直接相关的内容外，还应明确双方在新增开票部分下的其他权利和义务，如付款时间、付款方式、违约责任等，以保障双方的合法权益。

示例条款

《[原合同名称]补充协议》

甲方（全称）：[甲方公司名称] 乙方（全称）：[乙方公司名称]

鉴于甲乙双方于[原合同签订日期]签订了《[原合同名称]》（以下简称“原合同”），合同编号为[原合同编号]，约定了[简要概括原合同主要内容]。现因[详细说明新增开票的原因，如：在合同履行过程中，甲方额外向乙方提供了[具体货物或服务名称]，经双方协商一致，需就该部分业务另行开具发票]，经双方友好协商，就原合同开票相关事宜达成如下补充协议：

一、新增开票金额

1. 双方确认，因[上述新增业务原因]，乙方需向甲方开具金额为人民币[大写]元整（￥[小写金额]）的发票。该金额包含增值税，税率为[具体税率]，税额为人民币[大写]元整（￥[小写税额]）。

二、与原合同的关系

本补充协议是原合同的组成部分，与原合同具有同等法律效力。除本补充协议明确约定的事项外，原合同的其他条款继续有效。本补充协议与原合同不一致的，以本补充协议为准。

三、税务处理

1. 发票开具时间：乙方应在本补充协议签订后的[X]个工作日内，向甲方开具符合国家税收法律法规要求的增值税专用发票（或普通发票）。
2. 发票开具方式：乙方应按照甲方提供的开票信息，通过[具体开票方式，如邮寄、电子发票等]将发票送达甲方。
3. 抵扣规则：甲方收到乙方开具的合法有效的增值税专用发票后，应按照国家税收法律法规的规定进行认证和抵扣。

四、付款安排

1. 甲方应在收到乙方开具的符合要求的发票后的[X]个工作日内，向乙方支付本补充协议约定的款项人民币[大写]元整（￥[小写金额]）。
2. 付款方式：甲方通过[具体付款方式，如银行转账等]将款项支付至乙方指定的银行账户。乙方应在收到款项后[X]个工作日内，向甲方提供收款确认函。

五、违约责任

1. 若乙方未按照本补充协议约定的时间开具发票，每逾期一日，应按照未开具发票金额的[X%]向甲方支付违约金。逾期超过[X]日的，甲方有权解除本补充协议及原合同，并要求乙方承担因此给甲方造成的全部损失。
2. 若甲方未按照本补充协议约定的时间支付款项，每逾期一日，应按照未支付金额的[X%]向乙方支付违约金。逾期超过[X]日的，乙方有权暂停提供相关服务或货物，并要求甲方承担因此给乙方造成的全部损失。

六、争议解决

本补充协议在履行过程中如发生争议，双方应首先友好协商解决；协商不成的，任何一方均有权向有管辖权的人民法院提起诉讼。

七、其他条款

1. 本补充协议一式两份，甲乙双方各执一份，具有同等法律效力。
2. 本补充协议自双方签字（或盖章）之日起生效。

甲方（盖章）：__________________ 法定代表人（或授权代表）签字：______ 签订日期：___年_月____日

乙方（盖章）：__________________ 法定代表人（或授权代表）签字：______ 签订日期：___年_月____日

以上补充协议内容仅供参考，你可以根据实际情况进行调整和修改。如果在撰写过程中还有其他疑问，欢迎随时向我咨询。