行政执法超过办理期限的，当事人可以采取以下措施进行处理：

1. 催告与沟通
   首先，建议当事人主动与行政机关沟通，通过书面或口头形式催告其尽快履行职责。根据《中华人民共和国行政强制法》第五十四条，行政机关在收到催告书后，若仍不履行，当事人可进一步采取法律行动。此步骤有助于明确行政机关的态度，并为后续程序保留证据。

2. 申请行政复议
   若行政机关超期未作为，当事人可依据《中华人民共和国行政复议法》第十一条，在知道该行政行为之日起六十日内，向上一级行政机关或法定复议机构申请复议。复议机关将审查行政机关是否构成不作为，并责令其限期履行或确认违法。

3. 提起行政诉讼
   根据《中华人民共和国行政诉讼法》第四十六条，当事人可在知道行政机关不作为之日起六个月内，直接向法院提起诉讼。法院将审查行政机关的法定职责及超期理由，若认定违法，可能判决行政机关履行职责或赔偿损失。

4. 投诉与举报
   当事人可向行政机关的上级部门或监察机关投诉，反映超期未处理的问题。例如，通过政府服务热线、信访渠道或专门监督平台提交材料，促使行政机关内部启动督查程序。

5. 要求赔偿损失
   若行政机关的超期行为导致当事人合法权益受损（如经济损失、人身伤害等），可依据《中华人民共和国国家赔偿法》第四条，在行政复议或诉讼中一并提出赔偿请求，要求行政机关承担相应责任。

注意事项：

• 时效性：行政复议和诉讼均有严格期限限制，逾期可能丧失救济权利，需及时行动。
  
• 证据保留：保存与行政机关沟通的记录、申请材料、超期证明等，以支持后续主张。
  
• 专业协助：若案件复杂或涉及重大利益，建议委托律师协助梳理程序、撰写法律文书，提高维权效率。
  

如有进一步疑问或需具体指导，可直接向我咨询，我将结合案件细节提供针对性建议。