医疗期内一般不应扣减绩效工资，但具体情况需结合劳动合同、单位规章制度及地方性规定综合判断。以下从不同角度详细分析：

1. 医疗期的法律性质与工资支付原则

根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期是职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息，用人单位不得解除劳动合同的期限。在此期间，职工虽未提供劳动，但用人单位仍需支付病假工资或疾病救济费，且不得低于当地最低工资标准的80%（具体比例可能因地区而异）。

关键点：医疗期工资属于法定保障范围，其核心目的是保障职工基本生活，而非完全按绩效考核结果支付。因此，单位不得以“未提供劳动”为由直接扣减绩效工资，除非劳动合同或规章制度明确约定绩效工资与出勤或工作成果直接挂钩，且该约定不违反法律强制性规定。

2. 绩效工资的构成与扣减条件

绩效工资通常分为两部分：

• 固定绩效：与岗位价值、基本职责相关，属于工资组成部分，医疗期内一般不得扣减；
• 浮动绩效：与个人工作成果、出勤等挂钩，若劳动合同或规章制度明确约定“医疗期无绩效”或“按实际出勤比例发放”，且该约定经民主程序制定并公示，则可能被认定为合法。

示例：若单位规章制度规定“绩效工资=基本绩效（50%）+浮动绩效（50%），浮动绩效按实际出勤计算”，则医疗期内职工因未出勤，浮动绩效部分可能被扣减，但基本绩效仍需全额支付。

3. 地方性规定的差异

部分地区对医疗期工资支付有更详细的规定，例如：

• 上海：根据《上海市企业工资支付办法》，医疗期工资不得低于本企业月平均工资的40%，且不得低于最低工资标准；若劳动合同或集体合同另有约定，从其约定。
• 北京：要求医疗期工资按不低于最低工资标准的80%支付，但未明确禁止扣减绩效工资，需结合单位规章制度判断。

建议：职工可查询当地工资支付条例或咨询劳动部门，确认具体规定。

4. 单位违法扣减的法律后果

若单位无正当理由扣减医疗期绩效工资，职工可采取以下措施：

1. 协商：与单位沟通，要求补发工资；
2. 投诉：向当地劳动监察大队举报；
3. 仲裁/诉讼：申请劳动仲裁或提起诉讼，要求支付工资差额及经济补偿金。

法律依据：

• 《劳动合同法》第38条、第46条：单位未及时足额支付劳动报酬的，职工可解除合同并主张经济补偿；
• 《劳动争议调解仲裁法》第5条：发生劳动争议，可申请仲裁。

5. 实务建议

• 对职工：保留劳动合同、工资条、病假证明等证据，明确绩效工资构成及单位规章制度内容；
• 对单位：制定规章制度时需明确绩效工资扣减条件，并经民主程序公示，避免违法风险。

总结：医疗期工资支付需平衡法定保障与单位自主权。若您遇到具体纠纷，可直接向我咨询，我将结合您的劳动合同、单位规章制度及地方规定，提供针对性法律意见。