工程二次转包在大多数情况下是不合法的，其合法性需根据具体情况和相关法律法规进行判断。以下是对这一问题的详细分析：

一、法律依据与合法性判断

1. 《中华人民共和国建筑法》

   • 第二十八条明确规定，禁止承包单位将其承包的全部建筑工程转包给他人，也禁止将全部建筑工程肢解后以分包名义分别转包。这一条款直接否定了工程二次转包的合法性，除非符合特定条件（如经发包人同意且转包给有资质的单位）。
   • 第二十九条允许总承包单位在特定条件下将部分工程发包给有资质的分包单位，但强调主体结构必须由总承包单位自行完成，且禁止分包单位再分包。这进一步限制了工程转包的范围和条件。

2. 《中华人民共和国民法典》

   • 第七百九十一条也明确规定，承包人不得将其承包的全部建设工程转包给第三人或者将其承包的全部建设工程支解以后以分包的名义分别转包给第三人。这一条款从合同法的角度对转包行为进行了约束，明确了转包合同的无效性。

3. 《建设工程质量管理条例》

   • 第七十八条定义了转包行为，并规定了相应的法律责任，包括责令改正、没收违法所得、罚款、停业整顿、降低资质等级直至吊销资质证书等。这一条例为打击二次转包等违法行为提供了有力的法律武器。

二、合法与非法转包的具体情形

1. 合法转包（虽严格意义上不常见，但理论上存在可能）

   • 若原承包人在征得发包人同意的前提下，将整个工程或经允许的部分工程转包给具有相应资质的新承包人，且符合相关法律法规的规定（如转包部分非主体结构、新承包人具备相应资质等），则该转包行为可能被视为合法。但这种情况在实践中极为罕见，因为大多数工程合同和法律法规都倾向于限制或禁止转包。

2. 非法转包

   • 若原承包人未经发包人同意，或者将工程分包后再进行转包（即二次转包），或者新承包人不具备相应资质，甚至工程被多次转包，这些情形均违反了相关法律法规，因此转包行为不合法。非法转包不仅可能导致工程质量问题，还可能引发一系列法律纠纷和责任追究。

三、非法转包的法律后果

1. 转包合同无效

   • 根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第一条，因转包而签订的建设工程施工合同将被认定为无效。这意味着转包双方无法依据合同主张权利或履行义务。

2. 行政处罚

   • 依据《建设工程质量管理条例》第六十二条，承包单位将工程转包的，将面临责令改正、没收违法所得、罚款等行政处罚。罚款金额根据违规情况而定，最高可达工程合同价款的百分之一，并可能面临停业整顿、降低资质等级乃至吊销资质证书的严重后果。

3. 民事赔偿

   • 因转包导致的工程质量问题给建设单位造成损失的，转包单位与接受转包的单位应承担连带赔偿责任。这包括修复费用、延误工期造成的损失等。此外，若转包行为导致第三方人身或财产损害的，转包单位和接受转包的单位也可能需承担相应的民事赔偿责任。

四、建议与风险提示

• 对于建设单位而言：应选择有资质、信誉良好的承包商进行合作，并在合同中明确禁止转包行为。同时，应加强对工程建设的监管力度，确保工程质量符合标准。
• 对于承包商而言：应坚守诚信原则，依法依规进行工程建设和管理。若确需转包部分工程（虽不推荐），应事先征得发包人同意并确保新承包人具备相应资质。同时，应加强对分包单位的管理和监督，防止分包单位再分包或违法转包。
• 风险提示：工程二次转包不仅违法且风险极高。一旦被发现违法转包行为，相关单位和个人将面临严厉的法律制裁和经济损失。因此，建议各方严格遵守法律法规的要求，避免二次转包等违法行为的发生。

综上所述，工程二次转包在大多数情况下是不合法的，并可能引发一系列法律纠纷和责任追究。因此，在实际操作中应严格遵守相关法律法规的要求，确保工程的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。