结论：公司违法导致个人被判刑的情况下，个人是否可以申请赔偿，需根据具体情况来判断，主要包括公司是否构成侵权、是否存在赔偿协议以及刑事案件中的追缴、责令退赔等程序的影响。以下从不同角度进行详细分析：

1. 公司侵权导致个人被判刑

   • 法律背景：如果公司违法行为构成对个人的侵权（如诽谤、侵犯名誉权等），且该侵权行为直接导致个人被判刑（尽管这种情况较为罕见，因为判刑通常基于刑事犯罪），个人有权依据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的规定，向公司主张民事赔偿。
   • 法律建议：在此情况下，个人应收集充分证据证明公司的侵权行为与自己被判刑之间的因果关系，以及因此遭受的损失（如名誉损失、经济损失等），然后向法院提起民事诉讼，要求公司承担赔偿责任。

2. 公司违法但个人被判刑非直接由公司侵权导致

   • 法律背景：如果个人被判刑是基于自己参与的刑事犯罪，而非公司直接侵权行为导致，那么个人通常不能直接向公司申请民事赔偿。然而，如果个人在为公司工作过程中因执行公司职务而犯罪，且公司存在过错（如未提供必要的安全培训、未履行监管职责等），个人或其家属可能在一定程度上有权向公司主张补偿（非赔偿），但这通常依赖于具体的劳动合同、公司规章制度或相关法律法规的规定。
   • 特殊情况：在刑事案件中，如果法院判决追缴违法所得或责令退赔给被害人，而个人作为被害人之一，有权获得相应的退赔。但这并不构成对公司本身的赔偿请求，而是刑事案件执行程序的一部分。
   • 法律建议：在此情况下，个人应首先了解自己被判刑的具体原因和法律依据，然后评估公司是否存在过错或应承担的责任。如果认为公司应承担一定责任，可以尝试与公司协商解决；如果协商无果，可以考虑通过法律途径（如劳动仲裁、民事诉讼等）寻求救济，但需注意，这通常涉及复杂的法律关系和证据收集，建议咨询专业律师。

3. 存在赔偿协议的情况

   • 法律背景：如果个人与公司之间事先存在赔偿协议，且该协议合法有效，那么个人可以依据协议向公司主张赔偿。
   • 法律建议：在此情况下，个人应仔细审查赔偿协议的内容，确保自己的请求符合协议约定。如果公司拒绝履行协议，个人可以向法院提起诉讼，要求公司按照协议约定承担赔偿责任。

进一步思考：在处理此类问题时，个人应充分了解自己的法律权益和救济途径，同时注意收集和保存相关证据。由于刑事案件和民事赔偿涉及复杂的法律关系和程序，建议个人在遇到此类问题时及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。