针对您提出的“行政处罚多个违法主体怎么立案”的问题，以下是一个清晰、详细且具有深度的解答：
在行政处罚中，当涉及多个违法主体时，立案程序依然需要遵循行政处罚的基本流程，但需特别注意对每个违法主体的独立核查与处理。以下是具体的立案步骤：
一、发现与初步核查违法行为
多途径发现：
- 行政机关可以通过检查、投诉举报、移送与交办等多种途径发现涉及多个违法主体的案件线索。
- 例如，市场监督管理部门在例行检查中可能发现多个商家存在销售假冒伪劣产品的行为，或者消费者向食品药品监管部门同时举报多个餐厅的违规行为。
分别初步核查：
- 对每个涉嫌违法的主体进行独立的初步核查，核实案件来源和基本情况。
- 收集针对每个主体的初步证据，如询问相关人员、查阅资料、现场勘查等，确保每个主体的违法事实都有初步的证据支持。
二、分别填写立案审批表
- 对于每个涉嫌违法的主体，执法人员应分别填写立案审批表。
- 立案审批表应详细记录每个主体的案件来源、当事人信息、简要案情、立案依据及承办人员意见等。
三、审批流程
- 将每个主体的立案审批表分别报行政机关负责人审批。
- 负责人根据每个主体的核查情况和相关法律法规，分别决定是否立案，并签署意见。
- 对于不予立案的案件，需告知相关人员（特别是实名投诉举报人）并说明理由。
四、深入调查取证
- 立案后，执法人员将分别对每个涉嫌违法的主体进行深入调查取证。
- 调查过程中应遵守法定程序，保障每个当事人的合法权益，不得采取非法手段获取证据。
- 确保收集的证据能够充分证明每个主体的违法事实。
五、案件审查与处理
分别审查：
- 调查终结后，执法人员应分别撰写针对每个主体的调查报告并提出处理意见。
- 将所有证据材料和调查报告提交给行政机关的法制机构或指定的审核人员进行全面审查。
分别作出处罚决定：
- 根据审核结果，依法分别对每个涉嫌违法的主体作出行政处罚决定。
- 行政处罚决定书应载明每个当事人的基本情况、违法事实和证据、处罚依据、处罚种类和幅度、履行方式和期限、救济途径和期限等内容，并加盖行政机关印章。
六、送达与执行
- 将针对每个主体的行政处罚决定书分别送达当事人，并采取适当方式公告。
- 送达方式可以是直接送达、留置送达、邮寄送达、电子送达等。
- 当事人应在规定期限内履行行政处罚决定。逾期不履行的，行政机关可分别对每个主体采取强制执行措施。
七、结案归档
- 案件执行完毕后，执法人员应分别填写针对每个主体的结案报告。
- 将所有针对每个主体的案件材料整理归档，以备查阅和复核。
特别注意事项：
- 在处理涉及多个违法主体的案件时，行政机关应确保对每个主体的处理都是独立、公正且合法的。
- 不同地区的具体做法可能有所差异，且随着法律法规的不断更新和完善，流程也可能会有所调整。因此，在实际操作中，建议咨询当地行政机关或专业律师以获取最准确的信息和指导。
综上所述，当行政处罚涉及多个违法主体时，立案程序需要分别对每个主体进行独立的核查、审批、调查取证、审查处理、送达执行和结案归档。行政机关和执法人员应严格遵守相关法律法规和程序规定，确保行政处罚的合法性、公正性和有效性。