针对您提出的“局机关单位收在编工作人员的护照是否合法”的问题，我们可以从相关法律法规和纪律规定两个层面进行详细解答。

一、法律法规层面

根据《中华人民共和国护照法》的相关规定，护照是中华人民共和国公民出入国境和在国外证明国籍和身份的证件。该法并未直接规定单位可以收缴或保管员工的护照，但强调了护照的合法使用和管理的重要性。同时，该法也规定了护照的签发、换发、补发等具体流程，以及护照持有人应遵守的相关义务。

二、纪律规定层面

在纪律规定方面，特别是针对党员干部和公职人员，有更为详细和严格的要求。根据《中国共产党纪律处分条例》以及《关于加强国家工作人员因私事出国(境)管理的暂行规定》等相关文件，对于列入登记备案范围的人员（包括各级党政机关、事业单位在职的县（处）级以上领导干部等），其因私出国（境）证件在回国（境）后10日内，应交由所在单位组织人事部门集中保管。

三、具体解答

1. 对于一般公职人员：如果并非上述登记备案人员，单位一般无权要求收缴或保管其护照。护照作为个人身份和国籍的证明，其保管和使用应遵循个人意愿和法律法规的规定。

2. 对于登记备案人员：根据纪律规定，单位有权要求其在回国（境）后将护照交由组织人事部门集中保管。这是为了加强对公职人员出国（境）的管理，防止违规出国（境）行为的发生。

3. 合法性判断：因此，局机关单位收在编工作人员的护照是否合法，取决于该工作人员是否属于登记备案人员。如果属于登记备案人员，且单位按照纪律规定要求其交护照保管，则是合法的；如果不属于登记备案人员，或者单位未按照规定程序要求交护照，则可能涉及违法或违规行为。

四、建议

1. 了解个人身份：首先，您需要了解自己是否属于登记备案人员范畴。

2. 咨询单位规定：其次，您可以咨询所在单位的人事或组织部门，了解单位对于护照管理的具体规定和要求。

3. 遵守法律法规和纪律规定：最后，无论您是否属于登记备案人员，都应遵守相关法律法规和纪律规定，合理使用和保管自己的护照。

综上所述，局机关单位收在编工作人员的护照是否合法，需根据具体情况判断。如果您对此仍有疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询相关部门或专业人士。