两个未成年的孩子有了孩子，这一情况主要涉及刑事责任、民事责任以及子女的权益与保护问题，以下是对此的详细分析：

1. 刑事责任：

   • 未满14周岁：根据我国《刑法》规定，与不满14周岁的未成年人发生性关系，无论双方是否自愿，都可能以强奸罪论处（若行为人已满14周岁），并从重处罚。若双方均未满14周岁，虽不构成强奸罪，但司法机关会根据行为性质、情节等因素进行相应处理，如责令家长或监护人加强管教，必要时进行专门矫治教育。
   • 已满14周岁不满16周岁：此年龄段的未成年人，若与幼女（不满14周岁）发生性关系并构成犯罪，将以强奸罪定罪处罚。但如果是双方自愿且情节轻微、未造成严重后果，可能不视为犯罪，具体情况需综合判断，如双方年龄差距、是否明知对方年龄等。
   • 已满16周岁：年满16周岁的未成年人需承担完全刑事责任。虽然生育孩子本身不构成犯罪，但若在生育过程中涉及其他违法行为（如强奸、非法拘禁、虐待等），则将面临相应的刑事责任。

2. 民事责任：

   • 抚养责任：未成年人生育子女后，对子女负有抚养教育的义务。由于他们通常没有独立的经济能力，抚养责任常由其监护人代为履行，如孩子的祖父母、外祖父母等。若监护人无法履行抚养责任，可能需由社会福利机构等承担。
   • 赔偿责任：如果因生育子女给女方造成了身体伤害，男方及其监护人可能需承担相应的民事赔偿责任，包括医疗费、营养费、护理费等。同时，非婚生子女享有与婚生子女同等的权利，生父或生母应负担未成年子女的抚养费，直至子女能独立生活为止。

3. 子女的权益与保护：

   • 抚养权归属：抚养权判定一般遵循有利于子女身心健康和成长的原则。由于未成年父母往往不具备抚养条件，孩子通常由一方或双方的监护人实际抚养。法院会综合考虑双方家庭的经济状况、抚养意愿和能力、子女的生活习惯和情感需求等因素来判定抚养权归属。
   • 户口登记：非婚生子女享有与婚生子女同等的权利，不得受到歧视。孩子出生后，可按规定进行户口登记，随父或随母申报，需提供出生证明、父母身份证明等相关材料。
   • 社会保护与支持：社会应关注这类家庭，确保子女的合法权益得到保障。家庭、学校和社会应加强青少年的性教育，提高性知识和自我保护意识，预防类似情况的发生。对于已生育孩子的未成年人，应提供心理支持和辅导，帮助他们应对挑战和压力。政府和社会组织也应完善社会保障制度，为未成年生子家庭提供必要的帮助和支持，如经济援助、教育支持等。

在处理此类情况时，建议相关当事人及其监护人及时咨询专业律师，了解具体的法律责任和权益保护措施，以便更好地应对挑战和保护自身及子女的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。