核心结论：跟公司签了协议后，是否还可以申请仲裁，取决于协议的具体内容、签订背景以及所涉及的争议事项是否属于劳动仲裁的受案范围。以下分情况详细说明：

1. 协议内容合法且明确，且争议事项不属于劳动仲裁受案范围：

   • 如果双方签订的协议内容合法、明确，且所争议的事项不属于劳动仲裁的受案范围（例如，双方就非劳动关系事项达成的协议，或者协议中明确约定了争议解决方式为诉讼而非仲裁），则一般情况下，劳动者不能就该事项申请劳动仲裁。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条，劳动仲裁主要受理因确认劳动关系、订立、履行、变更、解除和终止劳动合同、工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护等发生的争议。若争议事项不在此列，则劳动仲裁机构可能不予受理。

2. 协议内容存在违法或不明确之处，或争议事项属于劳动仲裁受案范围：

   • 如果协议内容存在违法（如违反法律法规强制性规定）、显失公平、欺诈、胁迫等情形，或者协议内容不明确导致双方产生争议，且该争议事项属于劳动仲裁的受案范围，则劳动者仍然可以申请劳动仲裁。
   • 法律依据：同样根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，即使双方签订了协议，但若协议内容违法或存在其他导致协议无效或可撤销的情形，劳动者仍有权通过劳动仲裁等法律途径维护自己的合法权益。
   • 实践操作：在申请劳动仲裁时，劳动者需要提供相关证据证明协议存在违法或不明确之处，以及争议事项属于劳动仲裁的受案范围。劳动仲裁机构将根据双方提供的证据和法律规定进行裁决。

3. 协议中约定了仲裁条款，但后续发生争议：

   • 如果双方在协议中明确约定了仲裁条款，即约定了因协议产生的争议应提交仲裁机构解决，则后续发生争议时，双方应按照协议约定提交仲裁。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国仲裁法》第十六条，仲裁协议应当具有下列内容：（一）请求仲裁的意思表示；（二）仲裁事项；（三）选定的仲裁委员会。若协议中包含了有效的仲裁条款，则双方应受其约束。
   • 注意事项：即使协议中约定了仲裁条款，但若一方在仲裁前未向仲裁机构申请仲裁，而是直接向法院起诉，法院在受理前会审查是否存在有效的仲裁协议。若存在，法院将不予受理，并告知当事人向仲裁机构申请仲裁。

法律建议：

• 在签订任何协议前，务必仔细阅读协议内容，确保协议内容合法、明确，并充分了解协议的法律后果。
• 若对协议内容存在疑问或不确定之处，建议咨询专业律师或法律机构，以获取专业的法律意见。
• 若后续发生争议，且争议事项属于劳动仲裁的受案范围，建议及时向劳动仲裁机构申请仲裁，以维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 若劳动者在符合申请劳动仲裁的条件下未及时申请仲裁，可能导致超过仲裁时效而丧失胜诉权。
• 若劳动者在不符合申请劳动仲裁的条件下申请仲裁，可能被劳动仲裁机构不予受理或驳回仲裁请求。

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