在耕地上盖厂房一般是违法的，这主要涉及到土地用途管制和规划许可的问题。以下从不同角度为你详细分析：

土地用途管制角度

根据我国《土地管理法》的相关规定，国家实行土地用途管制制度。耕地属于农用地，其用途是用于农业生产，如种植农作物等。而厂房建设属于建设用地范畴，用于工业生产等活动。未经依法批准，擅自将耕地用于非农业建设，即改变土地用途，是违反土地用途管制制度的行为。

举例说明：假设某村民未经批准，在自己承包的耕地上搭建了厂房用于生产加工，这就属于擅自改变土地用途，是违法的。

规划许可角度

除了土地用途管制外，建设厂房还需要符合城乡规划的要求，并取得相应的规划许可。根据《城乡规划法》的规定，在城市、镇规划区内进行建筑物、构筑物、道路、管线和其他工程建设的，建设单位或者个人应当向城市、县人民政府城乡规划主管部门或者省、自治区、直辖市人民政府确定的镇人民政府申请办理建设工程规划许可证。在乡村规划区内进行乡镇企业、乡村公共设施和公益事业建设的，建设单位或者个人应当向乡、镇人民政府提出申请，由乡、镇人民政府报城市、县人民政府城乡规划主管部门核发乡村建设规划许可证。

举例说明：如果某企业计划在乡村的耕地上建设厂房，即使该耕地不属于基本农田，也需要先取得乡村建设规划许可证，否则就是违法建设。

法律后果

对于在耕地上违法建设厂房的行为，相关部门会依法进行查处。根据违法情节的轻重，可能会面临责令限期拆除、恢复土地原状、罚款等行政处罚。如果情节严重，构成犯罪的，还会依法追究刑事责任。

举例说明：某企业未经批准在耕地上建设了厂房，被国土资源部门发现后，责令其限期拆除并恢复土地原状，同时处以一定数额的罚款。如果该企业拒不执行，国土资源部门可以申请人民法院强制执行。

特殊情况说明

当然，也存在一些特殊情况，如因公共利益需要或符合土地利用总体规划和城乡规划，且经过依法批准，可以将耕地转为建设用地用于厂房建设。但这种情况需要严格履行审批手续，并符合相关法律法规的规定。

举例说明：某地区因发展工业需要，计划将一片耕地转为建设用地用于建设工业园区。在符合土地利用总体规划和城乡规划的前提下，经过依法批准，并办理了相关手续后，该工业园区得以合法建设。

如果你有在耕地上建设厂房的打算，或者已经遇到了相关法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。