工作单位发员工款是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：
如果单位发放的是员工应得的工资、奖金、津贴等合法收入：
- 这种情况下，单位发放员工款是合法的，也是其应尽的义务。根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者有权获得劳动报酬，单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
- 举例：员工按照劳动合同约定完成了工作任务，单位按照约定时间发放了工资和奖金，这是完全合法的行为。
如果单位以罚款、扣款等名义非法扣除员工工资或要求员工缴纳费用：
- 这种情况下，单位的行为可能是违法的。根据相关法律法规，单位不得随意扣除员工工资，除非有明确的法律依据（如员工违反规章制度造成损失，且损失金额经过合理核算）。同时，单位也不得要求员工缴纳任何非法费用，如“入职费”、“培训费”等。
- 举例：单位以员工迟到为由，未经员工同意擅自扣除其工资，且扣除金额超过合理范围，这种行为就可能构成违法。
如果单位发放的是非法所得或涉及违法活动的款项：
- 这种情况下，单位的行为无疑是违法的，且可能涉及刑事犯罪。员工如果接受并使用了这些款项，也可能面临法律责任。
- 举例：单位为了逃避税收，通过发放“奖金”的形式将部分收入以现金方式支付给员工，并要求员工不申报这部分收入，这种行为就构成了偷税漏税，是违法的。
法律建议：
- 对于员工来说，如果单位发放的款项是应得的合法收入，应当放心接受；如果单位存在非法扣除工资或要求缴纳非法费用的情况，应当及时与单位沟通协商，必要时可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
- 对于单位来说，应当严格遵守相关法律法规，合法合规地发放员工工资和奖金，不得随意扣除或要求员工缴纳非法费用。同时，也应当加强对员工的法律教育，提高员工的法律意识，共同维护良好的劳动关系。
可能后果：
- 如果单位存在非法扣除工资或要求缴纳非法费用的情况，可能会面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等；同时，也可能因此引发劳动争议，影响单位的声誉和正常运营。
- 如果员工接受并使用了单位发放的非法所得或涉及违法活动的款项，可能会面临法律责任，包括罚款、没收违法所得等；情节严重的，还可能构成犯罪，受到刑事处罚。
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