针对“员工早走了5分钟怎么办”这一问题，核心在于明确公司规章制度对此类行为的界定及处理方式。以下是具体分析：

1. 首先确认公司规章制度
   公司是否有明确的考勤制度，且该制度是否已通过民主程序制定（如职工代表大会讨论、公示等），并已向员工告知。若制度中明确规定了早退的处罚措施（如扣减工资、警告、记过等），则可依据制度执行。
   法律依据：根据《劳动合同法》第四条，用人单位应依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。规章制度需经民主程序制定并公示，否则可能因程序违法而无效。

2. 若制度未明确或程序不合法
   若公司无相关制度，或制度未经过民主程序、未公示，则无法直接依据制度处罚员工。此时可采取以下措施：

   • 与员工沟通：了解早退原因（如突发情况、交通问题等），若属偶发且无恶意，可口头提醒并记录，避免直接处罚引发矛盾。
     
   • 完善制度：若早退现象频繁，建议尽快修订考勤制度，明确早退的定义、处罚措施及程序，并通过民主程序公示后执行。
     

3. 处罚的合理性
   即使制度合法，处罚也需与早退行为的严重性相当。例如，早退5分钟与早退1小时的后果不同，处罚应体现区别。若处罚过重（如直接解除劳动合同），可能被认定为违法解除，需支付赔偿金。
   法律依据：根据《劳动合同法》第三十九条，劳动者严重违反用人单位规章制度的，用人单位可解除劳动合同。但“严重”需结合行为频率、后果等综合判断。

4. 特殊情况处理

   • 员工申请调休或补班：若员工因合理原因早退，可协商调休或补班，避免直接处罚。
     
   • 工会或职工代表意见：若公司有工会或职工代表，处罚前可听取其意见，确保程序公正。
     

总结建议：

1. 优先沟通：了解原因，区分偶发与故意，避免机械处罚。
   
2. 检查制度：确保制度合法有效，处罚措施明确且合理。
   
3. 完善流程：若需处罚，保留书面记录（如考勤表、员工签字确认的处罚通知等），避免纠纷。
   

如有具体案例或制度条款需要进一步分析，可随时向我咨询。