迟到被扣工资，若扣除部分超过劳动者当月工资的20%，或者扣除后剩余工资低于当地月最低工资标准，则属于违法行为。以下是对此问题的详细分析：
法律背景
根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则需按最低工资标准支付。这一规定旨在保护劳动者的基本生活需求，防止用人单位过度扣除工资。
具体分析
扣除比例限制：
- 用人单位因劳动者迟到而扣除工资时，扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。这是法律对用人单位扣除工资行为的具体限制，旨在防止用人单位滥用扣除工资的权利。
最低工资标准保障：
- 扣除工资后，劳动者的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。这是法律对劳动者基本生活需求的保障，确保劳动者在扣除工资后仍能维持基本生活。
合法扣除的情形：
- 除了因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的情况外，用人单位一般不得随意扣除劳动者工资。对于迟到等轻微违纪行为，用人单位可以通过其他管理手段（如警告、罚款（需符合公司规章制度且不超过法定限额）等）进行惩戒，但不应过度依赖扣除工资的方式。
法律建议
了解公司规章制度：
- 劳动者在入职前应仔细阅读公司规章制度，了解公司对迟到等违纪行为的处理方式及工资扣除规定。若公司规章制度违反法律法规，劳动者有权提出异议并要求修改。
保留证据：
- 若劳动者认为公司扣除工资的行为违法，应保留相关证据（如工资条、考勤记录、公司规章制度等），以便在维权时提供有力支持。
及时维权：
- 若劳动者发现公司扣除工资的行为违法，应及时向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
可能的法律后果
若用人单位违反法律规定扣除劳动者工资，将面临以下法律后果：
- 劳动监察部门处罚：劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行查处，并责令其限期改正。
- 劳动者索赔：劳动者有权要求用人单位返还被违法扣除的工资，并可能要求用人单位支付赔偿金。
总之，迟到被扣工资需遵守法律规定，不得过度扣除。若劳动者遇到违法扣除工资的情况，应及时维权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。