结论：针对您提出的“赔偿协议时间被甲方侵权，剩下的违约几天了，乙方该怎么办”的问题，这涉及到合同违约及赔偿的相关法律问题。乙方首先需要明确甲方侵权的具体内容，再根据合同条款和法律规定来采取相应的措施。以下是从不同角度为您进行的分析和建议：
一、明确甲方侵权的具体内容
侵权行为认定：
- 乙方需要仔细审查赔偿协议，明确甲方在哪些方面违反了协议约定，比如是否未按时支付赔偿款、是否未履行其他约定的义务等。
- 如果甲方确实存在违约行为，乙方应收集相关证据，如协议文本、支付记录、沟通记录等，以证明甲方的违约事实。
违约期限计算：
- 关于“剩下的违约几天了”的问题，乙方需要查看协议中关于违约期限的具体约定。
- 如果协议中有明确的违约期限或违约后的处理条款，乙方应按照协议约定来计算剩余的违约期限。
- 如果协议中没有明确约定，乙方可以与甲方协商确定一个合理的期限，或者根据法律规定和实际情况来推断。
二、采取相应的法律措施
与甲方协商：
- 在明确甲方违约后，乙方首先可以尝试与甲方进行协商，寻求和解或达成新的协议来解决问题。
- 协商过程中，乙方可以提出自己的诉求和理由，并听取甲方的意见和解释，以寻求双方都能接受的解决方案。
发送律师函或催告函：
- 如果协商无果，乙方可以考虑委托律师发送律师函或催告函给甲方，正式告知甲方其违约行为及可能面临的法律后果。
- 律师函或催告函通常具有法律威慑力，能够促使甲方重视问题并尽快采取行动。
提起诉讼或申请仲裁：
- 如果甲方仍然拒绝履行义务或无法达成和解，乙方可以根据协议中的争议解决条款或相关法律规定，向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁。
- 在诉讼或仲裁过程中，乙方需要提交相关证据来证明甲方的违约行为及自己的损失情况，并请求法院或仲裁机构作出公正的裁决。
三、法律后果及赔偿
违约责任：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
- 因此，如果甲方被认定存在违约行为，其可能需要承担继续履行协议、支付违约金或赔偿乙方损失等法律责任。
赔偿范围：
- 乙方的损失赔偿范围通常包括直接损失和间接损失。直接损失是指因甲方违约行为直接导致的财产减少或费用增加；间接损失是指因甲方违约行为而导致的乙方预期利益的丧失。
- 乙方在主张赔偿时，应尽可能提供充分的证据来证明自己的损失情况，以便法院或仲裁机构能够准确认定赔偿范围。
建议：
- 乙方在处理此类问题时，应保持冷静和理性，避免采取过激或违法的行为。
- 乙方应尽快收集相关证据并咨询专业律师的意见，以便更好地维护自己的合法权益。
- 如果乙方决定提起诉讼或申请仲裁，应提前了解相关程序和要求，并准备好必要的材料和证据。
如果您在处理此类问题时遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议和帮助。