结论前置：职工在事业单位请病假半年被扣积效工资是否合理，需结合具体情况判断，以下分情况说明：

1. 看单位规章制度是否合法有效
   事业单位有权根据自身情况制定内部规章制度，包括考勤、绩效工资发放等规定。但这些制度必须满足两个条件：一是内容合法，不能违反《劳动法》《劳动合同法》《事业单位人事管理条例》等法律法规；二是程序合法，需经职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，并公示或告知职工。
   如果单位规章制度明确规定“病假超过一定期限（如半年）扣积效工资”，且该制度合法有效，那么单位扣减积效工资的行为可能具有合理性。但需注意，即使制度有规定，扣减幅度也不能突破法律底线，比如不能将积效工资全部扣完，导致职工实际收入低于当地最低工资标准的80%（病假工资底线）。

2. 看职工病假是否符合法定条件
   职工请病假需提供合法有效的医疗证明，如医院出具的病假建议书、诊断证明等。如果职工提供的医疗证明真实有效，且病假符合法定条件（如因患病或非因工负伤需要停止工作医疗），单位应依法支付病假工资或疾病救济费。
   根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》（虽针对企业，但事业单位可参照），医疗期长度根据职工本人实际参加工作年限和在本单位工作年限确定，一般为3-24个月。在医疗期内，单位不得随意解除劳动合同，且应支付病假工资。如果职工病假在医疗期内，单位扣积效工资可能缺乏依据。

3. 看积效工资的性质和扣减方式
   积效工资通常与职工的工作业绩、出勤情况等挂钩。如果积效工资中明确包含“出勤绩效”部分，且职工因病假未出勤导致该部分无法获得，单位扣减该部分积效工资可能合理。但如果积效工资是职工固定收入的一部分，与出勤无关，或单位扣减的积效工资超出合理范围（如将与出勤无关的部分也扣减），则单位的行为可能违法。
   此外，即使扣减积效工资，单位也应确保职工病假期间的总收入（病假工资+剩余积效工资等）不低于当地最低工资标准的80%。如果扣减后职工收入低于该标准，单位需补足差额。

建议：

• 职工可先查阅单位规章制度，确认扣减积效工资的规定是否合法有效；
  
• 核对医疗证明是否真实有效，病假是否在医疗期内；
  
• 计算扣减后收入是否低于当地最低工资标准的80%；
  
• 如果认为单位行为违法，可与单位协商解决，或向劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁。
  

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