这种将工程款包装成劳务工资以降低税负的做法是不合法的，属于偷逃税款的违法行为。以下从几个方面进行详细分析：
税收法规层面：
- 工程款和劳务工资在税收法规中有明确的区分和不同的税率规定。工程款通常涉及增值税、企业所得税等税种，而劳务工资则主要涉及个人所得税。将工程款包装成劳务工资，实质上是改变了应税项目的性质，以逃避应缴纳的较高税率税款，这违反了税收法规中关于应税项目真实性和准确性的要求。
- 根据《中华人民共和国税收征收管理法》第六十三条，纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁帐簿、记帐凭证，或者在帐簿上多列支出或者不列、少列收入，或者经税务机关通知申报而拒不申报或者进行虚假的纳税申报，不缴或者少缴应纳税款的，是偷税。对纳税人偷税的，由税务机关追缴其不缴或者少缴的税款、滞纳金，并处不缴或者少缴的税款百分之五十以上五倍以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
合同与财务层面：
- 工程款和劳务工资在合同和财务记录中应有明确的区分和记录。如果故意将工程款记录为劳务工资，这不仅违反了合同的真实性原则，也违反了财务记录的准确性和完整性要求。这种行为可能导致合同无效或被撤销，同时也会对企业的财务状况和信誉造成负面影响。
法律责任层面：
- 对于这种偷逃税款的行为，税务机关有权进行税务稽查，并依法追缴税款、滞纳金和罚款。如果情节严重，构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。此外，这种行为还可能涉及虚假陈述、欺诈等法律责任，给相关责任人带来严重的法律后果。
建议：
- 企业应严格遵守税收法规和合同财务规定，确保应税项目的真实性和准确性。如果需要降低税负，应通过合法的税收筹划和优惠政策来实现，而不是采取偷逃税款等违法行为。
- 如果已经发生了这种违法行为，应尽快向税务机关自首并补缴税款、滞纳金和罚款，以减轻法律责任。同时，也应加强内部管理，完善合同和财务记录，防止类似行为再次发生。
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