结论：当事人头脑不清晰时所做的笔录，其能否作为立案依据，需根据具体情况判断，并非绝对不能立案，也非绝对可以立案。以下从多个角度进行详细分析：
一、笔录的法律效力与立案条件
笔录的法律效力：
- 笔录作为证据的一种，其法律效力取决于其真实性、合法性和关联性。若当事人在头脑不清晰的状态下做出笔录，可能影响笔录的真实性，进而影响其法律效力。
立案条件：
- 立案通常要求有明确的犯罪事实或民事纠纷，以及相应的证据支持。若笔录是唯一或主要证据，且其真实性受到质疑，则可能影响立案。
二、头脑不清晰对笔录的影响
自愿性与真实性：
- 头脑不清晰可能影响当事人的自愿性和真实性表达。若当事人在无法自主思考或判断的情况下做出笔录，该笔录可能被视为非自愿或非真实的，从而不具备法律效力。
证据能力：
- 在法律上，证据需要具备客观性、关联性和合法性。头脑不清晰时所做的笔录，可能因缺乏客观性或合法性（如未遵循法定程序）而被排除在证据之外。
三、不同情况下的处理
若笔录存在瑕疵但可补正：
- 如果笔录虽然存在头脑不清晰的问题，但其他证据能够佐证其真实性，或者通过其他方式（如重新询问、鉴定等）能够补正其瑕疵，则该笔录仍可能被采纳为证据，进而支持立案。
若笔录无法补正且严重影响案件事实认定：
- 如果笔录因头脑不清晰而无法补正，且对案件事实认定产生重大影响，则该笔录可能被排除在证据之外，导致无法立案或立案后因证据不足而撤案。
四、法律建议
对于当事人：
- 如果您或您认识的人在头脑不清晰的状态下被做了笔录，且担心该笔录可能影响案件处理，建议及时咨询专业律师，了解具体法律程序和权利救济途径。
对于执法机关：
- 执法机关在制作笔录时，应确保当事人处于清醒、自愿的状态，并遵循法定程序。如发现当事人头脑不清晰，应暂停询问，待其恢复清醒后再进行，或采取其他合法方式收集证据。
对于法院：
- 法院在审查笔录作为证据时，应严格审查其真实性、合法性和关联性。如发现笔录存在头脑不清晰等问题，应依法进行排除或要求补正，以确保案件处理的公正性和准确性。
总结：当事人头脑不清晰时所做的笔录，其能否作为立案依据需根据具体情况判断。在处理此类问题时，应充分考虑笔录的法律效力、立案条件以及头脑不清晰对笔录的影响，并依法采取相应措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。