双方笔录不一致并不影响立案，立案的核心在于犯罪事实的存在以及是否需要追究刑事责任，而非单纯依赖双方笔录的一致性。以下是对此观点的详细阐述与分析：

一、立案的决定因素

立案主要基于两个核心条件：一是犯罪事实的存在，二是需要追究刑事责任。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，公安机关在决定是否立案时，会重证据、重调查研究，不轻信口供。这意味着，即使双方笔录存在不一致，只要整体证据能够显示可能存在犯罪事实，并达到立案标准，司法机关就会依法立案。

二、笔录不一致的处理原则

1. 效力质疑与补正：若讯问笔录与讯问录音、录像内容存在重大实质性差异，根据《人民检察院刑事诉讼规则》，若不能补正或作出合理解释，该笔录不能作为批准或决定逮捕、提起公诉的依据。但这并不意味着不能立案，只是该笔录的效力会受到质疑，且司法机关会寻求其他证据来支持立案决定。

2. 综合审查判断：司法机关在立案阶段会对现有的证据材料进行综合审查判断，包括笔录、证人证言、初步的勘验检查等。当笔录不一致时，司法机关会结合其他证据进行综合分析，以查明事实真相。例如，在故意伤害案件中，加害方与受害方对于伤害行为的起因、经过等描述往往存在很大出入，但只要有其他证据表明确实发生了伤害行为，且达到了应当追究刑事责任的程度，司法机关就会依法立案。

三、其他证据的重要性

当双方笔录不一致时，其他证据的作用尤为凸显。公安机关会继续收集物证、书证、证人证言、监控录像等多种形式的证据，以验证或补充口供内容。这些证据在形成完整的证据链后，能够有力证明犯罪事实的存在，从而支持立案决定的合理性。例如，在盗窃案件中，即使犯罪嫌疑人与受害人的笔录不一致，但如果有监控录像显示犯罪嫌疑人进入了受害人的住所，并带走了受害人的财物，那么这一监控录像就可以作为重要证据支持立案。

四、法律程序与公正性保障

在法律程序中，确保公正和准确是核心原则。对于双方笔录不一致的情况，公安机关会依法进行审查和处理，确保程序的正当性和实体的公正性。如果发现被询问人存在故意作虚假陈述等违法行为，还会依法追究其法律责任，以维护法律的权威性和公信力。

五、实际建议

1. 积极配合调查：如果您的案件中涉及双方笔录不一致的情况，建议您积极配合司法机关的调查工作，提供真实、准确的陈述和证据。

2. 寻求专业帮助：在处理此类复杂案件时，建议您寻求专业律师的帮助。律师可以为您提供法律咨询、代理申诉、控告等服务，帮助您更好地维护自己的合法权益。

3. 关注证据收集：在案件处理过程中，要密切关注证据的收集情况。如果发现关键证据缺失或存在瑕疵，应及时向司法机关提出补充或完善证据的申请。

综上所述，双方笔录不一致并不直接决定能否立案。立案的决定取决于犯罪事实是否存在以及证据是否充分。在处理此类情况时，司法机关会依法进行审查和处理，确保程序的正当性和实体的公正性。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。