法院会根据申请人的优先顺序和具体情形来判决，一般情况下，会优先处理宣告死亡的申请，但若利害关系人达成一致意见，也可按其意见判决。具体分析如下：

1. 宣告失踪与宣告死亡的申请条件及法律后果

   • 宣告失踪：根据《民法典》第四十条，自然人下落不明满二年的，利害关系人可以向人民法院申请宣告该自然人为失踪人。宣告失踪后，失踪人的财产可以由其配偶、成年子女、父母或者其他愿意担任财产代管人的人代管，主要解决财产管理问题。
   • 宣告死亡：根据《民法典》第四十六条，自然人有下列情形之一的，利害关系人可以向人民法院申请宣告该自然人死亡：（一）下落不明满四年；（二）因意外事件，下落不明满二年。因意外事件下落不明，经有关机关证明该自然人不可能生存的，申请宣告死亡不受二年时间的限制。宣告死亡后，会产生与自然死亡相似的法律后果，如婚姻关系自动解除、财产按继承处理等。

2. 同一顺序利害关系人申请冲突的处理

   • 在本案中，张三下落不明满5年，其妻申请宣告失踪，其父申请宣告死亡。根据《民法典》第四十七条，对同一自然人，有的利害关系人申请宣告死亡，有的申请宣告失踪，符合本法规定的宣告死亡条件的，人民法院应当宣告死亡。由于张三下落不明已满5年，符合宣告死亡的条件，因此法院在一般情况下会优先处理宣告死亡的申请。

3. 利害关系人意见一致时的处理

   • 如果利害关系人（如张三的妻子和父亲）对宣告失踪或宣告死亡达成一致意见，法院也可以根据他们的意见来作出判决。这意味着，如果张三的妻子和父亲都同意先宣告失踪，法院也可以先宣告张三为失踪人。

4. 实际操作中的考量因素

   • 在实际操作中，法院还会考虑其他因素，如张三下落不明的具体原因、是否有证据表明张三可能仍然存活、宣告死亡或失踪对张三及其家庭的影响等。这些因素可能会影响法院的最终判决。