若土地作价出资超出约定或评估价值，需根据具体情形采取不同处理方式，以下是详细分析：

1. 若超出部分属于评估误差或市场波动导致
   根据《公司法》及相关司法解释，股东以非货币财产（如土地使用权）出资的，应当评估作价。若评估价值高于实际价值，且其他股东能证明评估存在明显高估（如评估方法错误、市场数据失真），可要求该股东补足差额或承担违约责任。
   操作建议：

   • 立即委托第三方机构重新评估土地价值，确认差额范围；
     
   • 查阅公司章程或出资协议，明确是否约定“高估处理条款”（如按实际价值调整股权比例）；
     
   • 若其他股东已因此受损，可要求该股东以现金或其他财产补足差额。

2. 若超出部分属于股东自愿多缴
   若股东明确表示愿意以高于评估价值的土地出资（例如为获取更多股权），且其他股东同意，法律不禁止此类行为。但需注意：

   • 公司章程限制：若章程规定“出资额不得超过评估价值”，需先修改章程；
     
   • 税务合规：土地增值部分可能涉及土地增值税、契税等，需按税务机关要求申报；
     
   • 工商登记：需在股东名册、公司章程中明确记载实际出资额及股权比例，避免后续纠纷。
     操作建议：
     
   • 签署书面协议，明确“超额出资”的性质（如视为对公司的赠与或额外资本投入）；
     
   • 办理土地过户手续时，按实际出资额缴纳税费；
     
   • 更新工商登记信息，确保股权结构清晰。

3. 若因土地权属瑕疵导致实际价值低于评估价值
   若土地存在抵押、查封、未缴清出让金等瑕疵，导致其实际价值低于评估价值，出资股东需承担瑕疵担保责任。其他股东可要求：

   • 解除出资协议并返还已投入资金；
     
   • 要求该股东以其他财产补足差额；
     
   • 若公司已因此受损，可追究其赔偿责任。
     操作建议：
     
   • 立即核查土地权属证明（如《国有土地使用证》）、出让合同、缴费凭证等文件；
     
   • 若发现瑕疵，要求出资股东在合理期限内消除（如解押、补缴出让金）；
     
   • 若无法消除，按前述方式追究责任。

总结：土地作价出资超出部分的处理需结合具体原因（评估误差、自愿多缴、权属瑕疵）和公司章程约定。建议优先通过协商解决，若协商不成，可依据《公司法》及相关司法解释主张权利。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。