结论：离职证明上虽写明“经双方协商一致”，但实际未履行赔偿的，劳动者后期仍可以申请仲裁要求赔偿。

分析如下：

1. 离职证明的法律效力： 离职证明是用人单位与劳动者解除劳动关系时出具的书面文件，主要证明双方劳动关系的终止及终止原因。离职证明上“经双方协商一致”的表述，通常意味着双方就离职事宜（包括可能的赔偿问题）已达成一致意见。然而，这一表述并不直接等同于赔偿问题已实际解决或用人单位已履行赔偿义务。

2. 赔偿协议的履行： 若双方在离职时确实就赔偿问题达成了协议，但用人单位未按照协议履行赔偿义务，劳动者有权依据该协议向用人单位主张权利。此时，离职证明上的“经双方协商一致”并不能作为用人单位免责的依据，因为该表述并未明确赔偿问题已实际解决。

3. 劳动仲裁的申请： 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动者与用人单位之间因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议，属于劳动仲裁的受理范围。因此，若用人单位未履行赔偿义务，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位支付相应的赔偿。

4. 举证责任： 在劳动仲裁过程中，劳动者需要承担一定的举证责任，以证明双方存在赔偿协议且用人单位未履行该协议。这可能包括提供离职证明、赔偿协议、沟通记录等相关证据。若劳动者能够提供充分证据证明其主张，劳动争议仲裁委员会将支持其请求。

法律建议：

• 保留证据：劳动者在离职时，应妥善保留与用人单位就赔偿问题达成的协议及相关沟通记录等证据。
• 及时申请仲裁：若用人单位未履行赔偿义务，劳动者应在法定期限内及时向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以免超过仲裁时效。
• 咨询专业律师：在申请仲裁前或仲裁过程中，劳动者可以咨询专业律师，以更好地了解自身权益及仲裁流程，提高仲裁成功率。

可能后果：

• 若劳动者能够提供充分证据证明其主张，劳动争议仲裁委员会将裁决用人单位支付相应的赔偿。
• 若劳动者无法提供充分证据或仲裁请求不成立，劳动争议仲裁委员会将驳回其请求。此时，劳动者可能需要通过其他途径（如诉讼）解决争议。