在债权有异议且对方提出时效抗辩的情况下，法院通常会先审理债权是否存在及其合法性，再审理时效抗辩是否成立。以下是对这一问题的详细分析：
一、债权异议的审理
债权存在性：
- 法院首先会审查债权是否真实存在。这包括审查债权债务关系是否依法成立，如是否有有效的合同、借据等债权凭证，以及这些凭证是否真实、合法、有效。
- 如果债权不存在或存在争议，法院将需要进一步查明事实，可能涉及举证责任的分配和证据的审查判断。
债权合法性：
- 除了审查债权是否存在，法院还会审查债权的合法性。即债权是否基于合法的原因产生，如是否违反法律法规的强制性规定，是否损害国家、集体或第三人的利益等。
- 如果债权不合法，法院将不会支持债权人的主张。
二、时效抗辩的审理
时效抗辩的提出：
- 在债权存在且合法的前提下，如果债务人提出时效抗辩，即主张债权已超过诉讼时效期间，法院将需要审查这一抗辩是否成立。
- 诉讼时效期间是法律规定的债权人请求法院保护其民事权利的期限，超过该期限，债权人将失去胜诉权。
时效抗辩的审查：
- 法院将审查债权人是否在诉讼时效期间内行使了请求权，如是否向债务人提出了履行请求、是否向法院提起了诉讼等。
- 如果债权人未在诉讼时效期间内行使请求权，且债务人提出时效抗辩，法院将可能认定债权已超过诉讼时效期间，从而驳回债权人的诉讼请求。
三、审理顺序的合理性
逻辑顺序：
- 先审理债权是否存在及其合法性，再审理时效抗辩是否成立，这是符合逻辑顺序的。因为如果债权本身不存在或不合法的，那么讨论时效抗辩就没有意义。
- 只有在债权存在且合法的前提下，时效抗辩的审理才有实际意义。
司法实践：
- 在司法实践中，法院通常会按照这一顺序进行审理。这有助于确保案件的审理效率和质量，避免不必要的诉讼资源浪费。
四、特殊情况下的处理
- 如果债权存在争议且涉及复杂的事实认定和法律适用问题，法院可能会先就债权争议进行审理并作出判决或裁定。在债权争议得到解决后，再就时效抗辩进行审理。
- 如果债权争议和时效抗辩的审理可以并行进行且不会相互干扰，法院也可能根据具体情况决定同时审理两者。
建议：在实际操作中，如果你作为债权人或债务人遇到此类问题，建议及时收集并整理相关证据材料，以便在诉讼中充分支持自己的主张或抗辩。同时，也可以考虑咨询专业律师（即我本人，李吉平律师，专注于债权债务领域），以获取更具体、更专业的法律建议。