针对“法院以执行完毕结案为由，排除妨害恢复执行不立案”的情况，核心解决路径是先通过法律程序确认原执行案件是否真正“执行完毕”，若未完毕或存在新妨害事实，可依法申请恢复执行或提起新的诉讼。以下是具体分析：

1. 核查原执行案件是否真正“执行完毕”

• 执行完毕的法定标准：根据《最高人民法院关于执行案件立案、结案若干问题的意见》第15条，执行完毕需满足“生效法律文书确定的执行内容全部实现”或“当事人达成执行和解协议且履行完毕”等条件。若原判决仅要求排除妨害（如拆除违建、返还土地等），但实际未完成物理排除或权利恢复，则不属于真正执行完毕。
• 操作建议：向法院申请调取原执行案件卷宗，核查执行笔录、现场照片、交付凭证等材料，确认是否完成全部执行内容。若发现执行不彻底（如仅部分拆除、未恢复原状），可据此主张原执行案件未完毕。

2. 若原执行未完毕，申请恢复执行

• 法律依据：根据《民事诉讼法》第264条，执行中或执行完毕后，若被执行人拒不履行和解协议或发现财产线索，可申请恢复执行。若原执行案件因“执行完毕”结案，但实际未完成，属于程序错误。
• 操作步骤：
  1. 提交书面《恢复执行申请书》，附原判决、执行裁定、未执行完毕的证据（如现场照片、第三方评估报告等）；
  2. 要求法院重新立案，并指定执行法官继续执行；
  3. 若法院仍拒绝，可向上级法院申请执行监督（根据《最高人民法院关于人民法院执行工作若干问题的规定（试行）》第71条）。

3. 若原执行已完毕但出现新妨害，需重新起诉或申请执行

• 新妨害的认定：若原执行案件已通过法院确认“执行完毕”（如完成交付、拆除等），但后续被执行人或第三方再次实施妨害行为（如重建违建、再次侵占），则属于新侵权事实，需通过新诉讼或执行程序解决。
  • 若新妨害违反原判决义务：可直接申请强制执行原判决（需证明新妨害与原判决义务直接相关）；
  • 若新妨害超出原判决范围：需另行提起“排除妨害纠纷”诉讼，获得新判决后再申请执行。
• 操作建议：收集新妨害的证据（如视频、报警记录、证人证言等），向法院提交《强制执行申请书》或起诉状，明确请求排除的具体妨害行为及法律依据。

4. 向检察院申请执行监督或提起申诉

• 适用情形：若法院无正当理由拒绝恢复执行或立案，可能涉及程序违法或司法不作为。
• 操作步骤：
  1. 向同级检察院提交《执行监督申请书》，附相关证据材料；
  2. 检察院可向法院发出检察建议，督促其纠正错误；
  3. 若仍无果，可向上一级法院或检察院申诉。

总结：先核查原执行是否真正完毕，若未完毕则申请恢复执行；若已完毕但出现新妨害，则通过新诉讼或执行程序解决；若法院存在程序错误，可申请执行监督或申诉。具体操作需结合案件细节，建议携带材料进一步沟通。