结论：在工程合同协议中，若甲乙双方约定共同承担资金风险，当出现符合起诉条件的情况时，乙方是可以起诉甲方的。不过，具体能否起诉以及起诉的结果，需结合合同具体约定、实际履行情况以及相关法律规定来综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

从合同约定角度

如果工程合同中明确约定了甲乙双方共同承担资金风险，并且对各自承担的比例、方式、条件等都有详细规定。当甲方没有按照合同约定履行其应承担的资金风险责任时，比如未按时投入约定资金、未承担应分担的资金损失等，这就构成了违约行为。根据《中华人民共和国民法典》第五百七十七条规定：“当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。”在这种情况下，乙方作为合同的一方，有权依据合同约定和法律规定，向法院提起诉讼，要求甲方承担相应的违约责任，如继续履行合同、赔偿损失等。

举例来说，甲乙双方签订工程合同，约定在项目资金短缺时，双方按照 5:5 的比例共同出资解决。在项目进行过程中，出现了资金短缺的情况，但甲方拒绝按照约定出资，导致项目进度受阻。此时，乙方就可以依据合同约定，起诉甲方要求其按照 50%的比例出资，并赔偿因甲方违约给乙方造成的损失，如延误工期产生的额外费用等。

从实际履行情况角度

即使合同中有共同承担资金风险的约定，但在实际履行过程中，情况可能会比较复杂。如果双方在实际履行中对合同约定进行了变更，或者存在一些口头协议等特殊情况，就需要综合考虑这些因素。例如，在项目实施过程中，双方口头协商改变了资金风险承担的比例，虽然没有书面变更合同，但双方都按照新的比例实际履行了一段时间。在这种情况下，如果之后又因为资金风险承担问题产生纠纷，法院可能会根据实际履行情况来认定双方的权利义务关系。

另外，如果是因为不可抗力等不可预见、不可避免的因素导致资金风险增加，双方对如何承担这部分新增风险没有明确约定，也可能引发纠纷。根据《中华人民共和国民法典》第五百九十条规定：“当事人一方因不可抗力不能履行合同的，根据不可抗力的影响，部分或者全部免除责任，但是法律另有规定的除外。因不可抗力不能履行合同的，应当及时通知对方，以减轻可能给对方造成的损失，并应当在合理期限内提供证明。当事人迟延履行后发生不可抗力的，不免除其违约责任。”在这种情况下，乙方起诉甲方时，法院会根据不可抗力的影响以及双方的实际情况，来判断甲方是否应该承担相应的责任以及承担责任的范围。

从相关法律规定角度

除了合同约定和实际履行情况，相关法律规定也是判断乙方能否起诉甲方以及起诉结果的重要依据。在建设工程领域，除了《中华人民共和国民法典》中关于合同的规定外，还有一些专门的法律法规，如《中华人民共和国建筑法》等。这些法律法规对建设工程合同的签订、履行、变更、终止等方面都做出了详细规定。如果甲方的行为不仅违反了合同约定，还违反了相关法律法规的规定，乙方在起诉时可以同时依据合同和法律来主张自己的权利。

例如，如果甲方在工程资金的使用上存在违规行为，如挪用工程资金、虚假出资等，这些行为可能不仅构成违约，还可能涉嫌违法犯罪。乙方在起诉甲方时，可以向法院提供相关证据，要求甲方承担违约责任的同时，也可以向相关部门举报甲方的违法行为。

建议：如果你遇到了工程合同中关于资金风险承担方面的纠纷，想要起诉甲方，建议你先仔细审查合同条款，收集好相关证据，如合同文本、付款凭证、沟通记录等。这些证据将有助于你证明甲方的违约行为以及你因此遭受的损失。同时，你也可以考虑咨询专业律师，让律师根据你的具体情况为你制定合适的诉讼策略，以提高胜诉的几率。如果你还有其他关于工程合同纠纷的问题，欢迎随时向我咨询。