针对您提出的“总公司中标，分公司履约开票收款是否合法”的问题，我们可以从法律法规、实际操作要点以及潜在风险等多个维度进行详细分析。
一、法律法规的合法性基础
公司法支持：
- 根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，分公司作为总公司的分支机构，虽然不具有独立的法人资格，但在总公司的授权范围内，有权从事包括收款和开票在内的民事活动。这为分公司代总公司收款开票提供了法律上的支持。
税法合规性：
- 《中华人民共和国发票管理办法》及其实施细则明确规定，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，在对外发生经营业务收取款项时，应向付款方开具发票。在分公司已办理税务登记并具备独立纳税资格的情况下，它可以在总公司的授权下开具发票。
- 税法并未严格禁止总公司中标后由分公司进行收款开票的操作模式，但要求业务必须真实，发票与实际交易相符。
民法典的代理规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以依法委托代理人实施民事法律行为。总公司与分公司之间的隶属关系使得总公司有权委托分公司进行收款和开票等民事活动。
二、实际操作中的要点
明确授权与合同约定：
- 总公司需出具明确的书面授权委托书，授权分公司代为收取款项和开具发票，并明确授权范围、期限等内容。
- 在总公司与客户签订的合同中，应明确约定由分公司收款开票的相关事宜，或在中标后与客户协商补充约定，以避免后续纠纷。
确保分公司具备开票资格：
- 分公司应依法向所在地主管税务机关办理税务登记，并取得相关证照。
- 确认分公司已完成税务登记并具备开票资格后，方可允许其进行开票操作。
财务与税务合规：
- 收款过程中应遵循财务管理制度，确保款项流向清晰透明。
- 分公司开票需确保符合税收征管的相关规定，准确申报纳税，避免税务风险。
三、潜在风险与注意事项
业务真实性的风险：
- 如果分公司未实际参与合同对应的业务，而纯粹为了开票而开票，将构成虚开发票行为，面临严重的法律后果。因此，必须确保业务的真实性。
税务处理不当的风险：
- 若总公司和分公司在税务处理上没有按照规定进行，可能导致纳税申报不准确，进而面临税务机关的处罚。因此，应确保税务处理的合规性。
合同纠纷与税务风险：
- 为确保安全合规，企业应确保相关手续齐全、合规，避免出现法律问题。同时，应尽量做到合同、发票、资金三流一致，以降低税务风险。
四、总结与建议
综上所述，总公司中标后委托分公司履约开票收款在符合相关法律法规和合同约定的情况下是合法的。但为确保操作的合法性和规范性，建议总公司在委托分公司收款开票前，务必进行充分的法律审查和风险评估。确保分公司具备相应的法律地位和资质，并严格遵守税务规定和合同条款。同时，加强内部管理和监督，确保整个过程的合法合规性。这样不仅可以降低潜在的法律风险，还可以提升企业的信誉和竞争力。