旅行社在申请办理过程中自行变更了法人，这一行为主要涉及到旅行社的登记事项变更问题。根据《旅行社条例》及其实施细则的相关规定，我们可以对此性质进行如下详细分析：

首先，旅行社的法人变更属于登记事项变更的范畴。旅行社作为企业法人，其名称、经营场所、法定代表人等登记事项的变更，都需要按照相关法律法规的规定进行办理。这是确保旅行社合法经营、维护市场秩序的重要一环。

其次，旅行社在变更法人后，有义务及时向原许可的旅游行政管理部门进行备案。根据《旅行社条例实施细则》第十二条的规定，旅行社在办理完法人变更登记后，应当持已变更的《企业法人营业执照》向原许可的旅游行政管理部门备案。这一步骤是确保旅游行政管理部门能够及时了解旅行社的最新情况，以便对其进行有效的监管。

再者，如果旅行社未按照规定进行备案，可能会面临一定的法律后果。虽然具体的法律后果可能因地区而异，但一般来说，未按照规定进行备案的旅行社可能会受到旅游行政管理部门的警告、罚款等行政处罚，甚至可能影响其旅行社业务经营许可证的换领或交回。

综上所述，旅行社在申请办理过程中自行变更法人，这一行为属于登记事项变更的范畴，且需要按照相关法律法规的规定及时向原许可的旅游行政管理部门进行备案。这是旅行社合法经营、维护市场秩序的重要一环，也是避免潜在法律风险的关键步骤。因此，建议旅行社在变更法人后，务必及时办理相关备案手续。